基因页面:C17orf53

总结吗?
GeneID 78995年
象征 C17orf53
同义词 - - - - - -
描述 17号染色体开放阅读框53岁
参考 HGNC: HGNC: 28460|运用:ENSG00000125319|HPRD: 08825|织女:OTTHUMG00000181808
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 17 q21.31
帕斯卡假定值 0.158
胎儿β 0.605
DMG 1(#研究)
eGene 迈尔斯的顺式和反式

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Jaffe_2016 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 1

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg11317019 17 42219250 C17orf53 6.48 e-11 -0.022 4.34 e - DMG: Jaffe_2016

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs1642598 chr17 42045211 C17orf53 78995年 0.16 独联体

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
NENF 0.91 0.83
提示2 0.87 0.77
C2orf7 0.87 0.79
FTL 0.87 0.78
MSRB2 0.86 0.81
COX5B 0.86 0.77
MT3 0.86 0.79
SELM 0.86 0.79
C17orf61 0.86 0.71
PSMB10 0.85 0.81
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
UPF2 -0.61 -0.66
GIGYF2 -0.61 -0.67
ZC3H13 -0.60 -0.68
RBM25 -0.60 -0.76
SLTM -0.59 -0.64
CLIP1 -0.59 -0.65
ZNF326 -0.59 -0.71
USP34 -0.59 -0.66
ZNF638 -0.59 -0.67
RBM26 -0.59 -0.68

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
IWANAGA E2F1目标引起的血清 31日 19 所有SZGR 2.0基因通路
DN NUYTTEN EZH2目标 1024年 594年 所有SZGR 2.0基因通路
伊万诺娃早期造血祖 532年 309年 所有SZGR 2.0基因通路
马森受E2F4如果 728年 415年 所有SZGR 2.0基因通路
迈斯纳大脑HCP H3K4ME2和H3K27ME3 59 35 所有SZGR 2.0基因通路
通过AKT1 BHAT ESR1目标 281年 183年 所有SZGR 2.0基因通路
GOBERT少突细胞分化了 570年 339年 所有SZGR 2.0基因通路
DN KATSANOU ELAVL1目标 148年 88年 所有SZGR 2.0基因通路
德拉克洛瓦RAR绑定西文 462年 273年 所有SZGR 2.0基因通路
由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 1839年 928年 所有SZGR 2.0基因通路