Gene Page:卡德gydF4y2Ba

概括gydF4y2Ba?
基因gydF4y2Ba 790
象征gydF4y2Ba 卡德gydF4y2Ba
Synonyms CDG1Z
Description carbamoyl-phosphate synthetase 2, aspartate transcarbamylase, and dihydroorotase
Reference MIM：114010gydF4y2Ba|HGNC:HGNC:1424|Ensembl：ENSG00000084774gydF4y2Ba|HPRD:06437|Vega:OTTHUMG00000097070
Gene type protein-coding
Map location 2p22-p21
Pascal p-value 0.005gydF4y2Ba
Fetal beta 0.308
eGene Myers' cis & trans
Support Ascano FMRP targets

数据源中的基因gydF4y2Ba
Gene set name Method of gene set Description Info
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS
PMID:cooccur High-throughput literature-search Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学gydF4y2Ba High-throughput literature-search Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenic,schizophrenias,schizotypal Click to show details
GO_Annotation Mapping neuro-related keywords to Gene Ontology annotations 与神经相关的关键字的命中：1gydF4y2Ba
Network 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离gydF4y2Ba Contribution to shortest path in PPI network: 0.0139

第一节遗传学和表观遗传学注释gydF4y2Ba

@eQTL annotation

SNP IDgydF4y2Ba Chromosome Position eGene Gene Entrez ID pvalue qvalue TSS distance eQTL type
rs10994209 chr10 61877705 卡德gydF4y2Ba 790 0.01 trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：gydF4y2Ba
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：gydF4y2Ba
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
DOK7 0.86 0.32
GALNT14 0.83 0.61
NTNG1 0.83 0.61
NECAB2 0.82 0.55
CPNE7 0.81 0.66
SLC17A6 0.80 0.60
PCOLCE2gydF4y2Ba 0.80 0.61
TP53I3 0.80 0.41
C3orf55gydF4y2Ba 0.79 0.58
PKIB 0.77 0.55
Top 10 negatively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
KIAA1614 -0.23 0.04
CIDEA -0.22 -0.04
OAF -0.22 -0.26
CRLF1 -0.22 -0.17
SLC26A4 -0.21 0.04
EMX1 -0.20 0.01
AF347015.2 -0.20 -0.34
IER5LgydF4y2Ba -0.19 0.06
ZEB2 -0.19 0.02
GRIN2C -0.19 -0.20

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语gydF4y2Ba Evidence Neuro keywords PubMed IDgydF4y2Ba
GO:0004088 carbamoyl-phosphate synthase (glutamine-hydrolyzing) activity TAS glutamate (GO term level: 6) 8619816gydF4y2Ba
去：0004070gydF4y2Ba aspartate carbamoyltransferase activity IEA -
GO:0004151 二氢酶活性gydF4y2Ba 经验gydF4y2Ba 8619816gydF4y2Ba
GO:0004151 二氢酶活性gydF4y2Ba IEA -
GO:0004086 carbamoyl-phosphate synthase activity IEA -
GO:0005524 ATP binding IEA -
GO:0016874 ligase activity IEA -
GO:0016740 转移酶活性gydF4y2Ba IEA -
GO:0008270 zinc ion binding IEA -
GO:0016597 amino acid binding IEA -
GO:0046872 metal ion binding IEA -
生物过程gydF4y2Ba 去的术语gydF4y2Ba Evidence Neuro keywords PubMed IDgydF4y2Ba
GO:0006520 amino acid metabolic process IEA -
去：0006221gydF4y2Ba pyrimidine nucleotide biosynthetic process IEA -
GO:0006207 'de novo' pyrimidine base biosynthetic process IEA -
去：0009058gydF4y2Ba 生物合成过程gydF4y2Ba IEA -
去：0006807gydF4y2Ba nitrogen compound metabolic process IEA -
GO:0006541 glutamine metabolic process IEA -
Cellular component 去的术语gydF4y2Ba Evidence Neuro keywords PubMed IDgydF4y2Ba
GO:0005829 cytosol 经验gydF4y2Ba 8619816gydF4y2Ba
GO:0005737 细胞质gydF4y2Ba IEA -

V.途径注释gydF4y2Ba

Pathway name Pathway size # SZGR 2.0 genes in pathway Info
KEGG PYRIMIDINE METABOLISM 98 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
KEGG ALANINE ASPARTATE AND GLUTAMATE METABOLISM 32 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
ST FAS SIGNALING PATHWAY 65 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
PID MYC ACTIV PATHWAY 79 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
REACTOME METABOLISM OF NUCLEOTIDES 72 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
反应组嘧啶代谢gydF4y2Ba 24 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
GAZDA钻石黑芬贫血祖先DNgydF4y2Ba 66 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP 1382 904gydF4y2Ba 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
DEURIG T细胞PROLYMPHOCYTIC白血病gydF4y2Ba 368 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
BASAKI YBX1 TARGETS UP 290 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
多德鼻咽癌DNgydF4y2Ba 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
开罗PML的目标是由Myc Up绑定gydF4y2Ba 23 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
MISSIAGLIA REGULATED BY METHYLATION DN 122 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
MATTIOLI MGUS VS PCL 116 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
MATTIOLI MGUS VS MULTIPLE MYELOMA 16 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
MATTIOLI MULTIPLE MYELOMA SUBGROUPS 16 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
MARTORIATI MDM4 TARGETS NEUROEPITHELIUM UP 176 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
MARTORIATI MDM4 TARGETS FETAL LIVER DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
PUJANA XPRSS INT NETWORK 168 103gydF4y2Ba 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
PUJANA BRCA2 PCC NETWORK 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
PUJANA ATM PCC NETWORK 1442gydF4y2Ba 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
PUJANA CHEK2 PCC NETWORK 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
PUJANA BRCA CENTERED NETWORK 117 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
NUYTTEN EZH2 TARGETS DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
BENPORATH MYC MAX TARGETS 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
PENG LEUCINE DEPRIVATION DN 187 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
MANALO HYPOXIA DN 289 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
FLECHNER PBL KIDNEY TRANSPLANT OK VS DONOR UP 151 100gydF4y2Ba 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
SCHUHMACHER MYC TARGETS UP 80 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
POMEROY MEDULLOBLASTOMA PROGNOSIS DN 43 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
PENG GLUTAMINE DEPRIVATION DN 337gydF4y2Ba 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
Hedenfalk乳腺癌遗传与零星gydF4y2Ba 50 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
RAMALHO STEMNESS UP 206gydF4y2Ba 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
BURTON ADIPOGENESIS 2 72 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
BURTON ADIPOGENESIS PEAK AT 24HR 43 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
CUI TCF21 TARGETS 2 UP 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
DEBIASI APOPTOSIS BY REOVIRUS INFECTION DN 287 208gydF4y2Ba 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
BACOLOD RESISTANCE TO ALKYLATING AGENTS DN 60 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
WELCSH BRCA1 TARGETS DN 141 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
MARCHINI TRABECTEDIN RESISTANCE DN 49 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
Creighton内分泌疗法抗性1gydF4y2Ba 528 324gydF4y2Ba 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
MARSON BOUND BY FOXP3 STIMULATED 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
SANSOM APC TARGETS REQUIRE MYC 210gydF4y2Ba 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
Rizki肿瘤侵入性2DgydF4y2Ba 69 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
Mitsiades对aplidin DN的反应gydF4y2Ba 249 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
WEST ADRENOCORTICAL TUMOR UP 294 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
MOOTHA MITOCHONDRIA 447gydF4y2Ba 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
Boylan多发性骨髓瘤C簇gydF4y2Ba 38 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
BOYLAN MULTIPLE MYELOMA C UP 47 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
SHEDDEN LUNG CANCER POOR SURVIVAL A6 456gydF4y2Ba 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
iritani mad1靶向DNgydF4y2Ba 47 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
PUJANA BREAST CANCER WITH BRCA1 MUTATED UP 56 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
FOURNIER ACINAR DEVELOPMENT LATE 2 277 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
开罗肝母细胞瘤上课gydF4y2Ba 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
DANG MYC TARGETS UP 143 100gydF4y2Ba 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
DANG BOUND BY MYC 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 11 103gydF4y2Ba 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 14 143 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
BAE BRCA1 TARGETS DN 32 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
WIERENGA PML INTERACTOME 42 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
PILON KLF1 TARGETS DN 1972 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
LEE BMP2 TARGETS DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba
PURBEY TARGETS OF CTBP1 NOT SATB1 DN 448gydF4y2Ba 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因gydF4y2Ba