基因页:cuedc2
概括?
基因 | 79004 |
象征 | cuedc2 |
同义词 | C10ORF66 | BA18I14.5 |
描述 | 包含2的提示域 |
参考 | MIM:614142|HGNC:HGNC:28352|ENSEMBL:ENSG00000107874|HPRD:13099|Vega:Otthumg0000000018958 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 10q24.32 |
Pascal P值 | 1.825E-4 |
Sherlock P值 | 0.212 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7132043 | CHR12 | 80968399 | cuedc2 | 79004 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CUEDC2_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
COQ6 | 0.81 | 0.78 |
加巴拉普 | 0.79 | 0.78 |
ADSL | 0.79 | 0.78 |
VRK3 | 0.78 | 0.75 |
WDR61 | 0.78 | 0.77 |
AUP1 | 0.78 | 0.72 |
tusc4 | 0.77 | 0.75 |
mpdu1 | 0.77 | 0.71 |
PSMA5 | 0.77 | 0.76 |
Thyn1 | 0.77 | 0.72 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.26 | -0.60 | -0.60 |
AF347015.8 | -0.59 | -0.55 |
mt-cyb | -0.58 | -0.55 |
AF347015.18 | -0.58 | -0.62 |
AF347015.2 | -0.58 | -0.55 |
AF347015.15 | -0.58 | -0.55 |
MT-ATP8 | -0.56 | -0.58 |
AF347015.27 | -0.56 | -0.53 |
MT-CO2 | -0.55 | -0.50 |
AF347015.33 | -0.54 | -0.53 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LE EGR2目标 | 108 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAL PRMT5靶向 | 203 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chung水泡细胞毒性 | 134 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇的时间反应13 | 172 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Li DCP2绑定mRNA | 89 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN | 448 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |