基因页:ZFYVE21
概括?
基因 | 79038 |
象征 | ZFYVE21 |
同义词 | HCVP7TP1 | ZF21 |
描述 | 锌指FYVE型含有21个 |
参考 | MIM:613504|HGNC:HGNC:20760|Ensembl:ENSG00000100711|HPRD:15733|Vega:Otthumg00000171651 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 14Q32.33 |
Pascal P值 | 5.156e-12 |
Sherlock P值 | 0.255 |
胎儿β | -1.067 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG04984818 | 14 | 104195301 | ZFYVE21 | 5.506E-4 | 0.467 | 0.049 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZFYVE21_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
axin1 | 0.96 | 0.95 |
ZNF446 | 0.96 | 0.96 |
Gmip | 0.96 | 0.95 |
KIAA1543 | 0.95 | 0.95 |
mast2 | 0.95 | 0.96 |
CCDC120 | 0.95 | 0.96 |
GPSM1 | 0.95 | 0.95 |
AD000671.1 | 0.95 | 0.94 |
AC145098.2 | 0.95 | 0.96 |
MTA1 | 0.95 | 0.96 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.74 | -0.89 |
AF347015.27 | -0.73 | -0.88 |
C5orf53 | -0.72 | -0.75 |
MT-CO2 | -0.72 | -0.87 |
AF347015.33 | -0.71 | -0.84 |
S100B | -0.71 | -0.81 |
HLA-F | -0.71 | -0.72 |
COPZ2 | -0.71 | -0.80 |
AIFM3 | -0.70 | -0.72 |
mt-cyb | -0.70 | -0.85 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Sengupta鼻咽癌DN | 349 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素的反应 | 612 | 367 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应中间 | 98 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |