基因页:ALG8
总结?
基因 | 79053 |
象征 | ALG8 |
同义词 | CDG1H |
描述 | Alg8,alpha-1,3-葡萄糖基转移酶 |
参考 | MIM:608103|HGNC:HGNC:23161|ENSEMBL:ENSG00000159063|HPRD:10480|Vega:Otthumg00000166594 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11q14.1 |
Pascal P值 | 0.009 |
Sherlock P值 | 0.728 |
主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS9651741 | 11 | 77746185 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 1.655E-6 | 0 | 104521 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12273220 | 11 | 77753705 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 1.617E-6 | 0 | 97001 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12275399 | 11 | 77755559 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 4.254e-6 | 0 | 95147 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10793279 | 11 | 77764871 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 2.186E-6 | 0 | 85835 | gtex_brain_putamen_basal |
RS35532994 | 11 | 77767930 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 5.992E-7 | 0 | 82776 | gtex_brain_putamen_basal |
RS35669928 | 11 | 77767948 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 6.065e-7 | 0 | 82758 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6592762 | 11 | 77768117 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 3.474E-6 | 0 | 82589 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7122205 | 11 | 77770232 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 6.929E-7 | 0 | 80474 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11237372 | 11 | 77771253 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 1.231E-6 | 0 | 79453 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11237374 | 11 | 77773926 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 1.237E-6 | 0 | 76780 | gtex_brain_putamen_basal |
RS17825572 | 11 | 77774017 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 1.237E-6 | 0 | 76689 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2282639 | 11 | 77774599 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 1.237E-6 | 0 | 76107 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10899435 | 11 | 77777019 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 1.246E-6 | 0 | 73687 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9651743 | 11 | 77777188 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 1.246E-6 | 0 | 73518 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9651744 | 11 | 77777402 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 4.135E-7 | 0 | 73304 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10793281 | 11 | 77777821 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 4.432E-7 | 0 | 72885 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10751280 | 11 | 77784380 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 1.345E-6 | 0 | 66326 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11237378 | 11 | 77785453 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 5.03e-7 | 0 | 65253 | gtex_brain_putamen_basal |
RS61141394 | 11 | 77785536 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 1.237E-6 | 0 | 65170 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12276887 | 11 | 77785626 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 4.615E-7 | 0 | 65080 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12276891 | 11 | 77785645 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 1.334E-6 | 0 | 65061 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11237379 | 11 | 77785957 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 1.237E-6 | 0 | 64749 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2154963 | 11 | 77796139 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 1.194E-6 | 0 | 54567 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10793284 | 11 | 77810806 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 3.725E-7 | 0 | 39900 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10793285 | 11 | 77811196 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 3.725E-7 | 0 | 39510 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1075202 | 11 | 77813207 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 1.293E-7 | 0 | 37499 | gtex_brain_putamen_basal |
RS71046955 | 11 | 77816764 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 5.399E-7 | 0 | 33942 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10751281 | 11 | 77820168 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 3.725E-7 | 0 | 30538 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10899440 | 11 | 77825275 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 3.727E-7 | 0 | 25431 | gtex_brain_putamen_basal |
RS72946531 | 11 | 77826985 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 3.907E-7 | 0 | 23721 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12146488 | 11 | 77830048 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 4.97E-7 | 0 | 20658 | gtex_brain_putamen_basal |
RS144307072 | 11 | 77834060 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 2.725E-6 | 0 | 16646 | gtex_brain_putamen_basal |
RS140013289 | 11 | 77834078 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 3.082e-6 | 0 | 16628 | gtex_brain_putamen_basal |
RS61454279 | 11 | 77838011 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 4.984e-7 | 0 | 12695 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12273235 | 11 | 77842614 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 1.777E-7 | 0 | 8092 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10793287 | 11 | 77846706 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 2.008e-7 | 0 | 4000 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10793289 | 11 | 77850517 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 5.97E-7 | 0 | 189 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2156785 | 11 | 77850824 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 2.186E-6 | 0 | -118 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11237410 | 11 | 77851606 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 5.882e-7 | 0 | -900 | gtex_brain_putamen_basal |
RS58463648 | 11 | 77852147 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 1.004E-6 | 0 | -1441 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7101694 | 11 | 77853896 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 2.431E-7 | 0 | -3190 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1263732 | 11 | 77858421 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 1.364E-6 | 0 | -7715 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1263727 | 11 | 77862719 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 1.46E-6 | 0 | -12013 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1263726 | 11 | 77864023 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 1.268E-6 | 0 | -13317 | gtex_brain_putamen_basal |
RS977978 | 11 | 77865936 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 1.533E-6 | 0 | -15230 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4015965 | 11 | 77866882 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 3.595 e-6 | 0 | -16176 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1263578 | 11 | 77867049 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 1.428E-6 | 0 | -16343 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1263577 | 11 | 77869742 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 1.614 e-6 | 0 | -19036 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1151183 | 11 | 77870638 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 1.623E-6 | 0 | -19932 | gtex_brain_putamen_basal |
RS28547 | 11 | 77872876 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 1.623E-6 | 0 | -22170 | gtex_brain_putamen_basal |
RS230667 | 11 | 77877369 | ALG8 | ENSG00000159063.8 | 1.658E-6 | 0 | -26663 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ALG8_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
猫 | 0.68 | 0.47 |
Fam3a | 0.67 | 0.62 |
马尔 | 0.66 | 0.45 |
忍者 | 0.66 | 0.48 |
elovl1 | 0.65 | 0.53 |
C12orf62 | 0.65 | 0.56 |
CAPN3 | 0.65 | 0.50 |
SNX22 | 0.65 | 0.58 |
inpp1 | 0.65 | 0.65 |
arl2 | 0.65 | 0.64 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PBX1 | -0.32 | -0.12 |
EPHB1 | -0.32 | -0.17 |
Sox4 | -0.32 | -0.23 |
XPR1 | -0.32 | -0.16 |
Robo1 | -0.31 | -0.10 |
Bcl11b | -0.31 | -0.06 |
ROBO2 | -0.30 | -0.09 |
gadl1 | -0.30 | -0.11 |
IGSF3 | -0.30 | -0.08 |
BRWD3 | -0.29 | -0.14 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg n glycan生物合成 | 46 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome术后翻译蛋白修饰 | 188 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome天冬酰胺N连接的糖基化 | 81 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
N Glycan前体Dolichol脂质的寡糖LLO的Reactome生物合成并转移到新生蛋白 | 29 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser MYC靶向血清抑制 | 159 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Buytaert光动力疗法应力DN | 637 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌11q12 Q14 Amplicon | 158 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Peng Leucine剥夺DN | 187 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Magrangeas多发性骨髓瘤IgLL与IgLK DN | 24 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭谷氨酰胺剥夺DN | 337 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 | 281 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID乳腺癌腔内B | 172 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fournier腺泡开发2 | 277 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gutierrez多发性骨髓瘤 | 35 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞DN | 428 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |