总结
基因 79053
象征 ALG8
同义词 CDG1H
描述 Alg8,alpha-1,3-葡萄糖基转移酶
参考 MIM:608103|HGNC:HGNC:23161|ENSEMBL:ENSG00000159063|HPRD:10480|Vega:Otthumg00000166594
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11q14.1
Pascal P值 0.009
Sherlock P值 0.728
主持人 尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
伏隔核基底神经节
梭子基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS9651741 11 77746185 ALG8 ENSG00000159063.8 1.655E-6 0 104521 gtex_brain_putamen_basal
RS12273220 11 77753705 ALG8 ENSG00000159063.8 1.617E-6 0 97001 gtex_brain_putamen_basal
RS12275399 11 77755559 ALG8 ENSG00000159063.8 4.254e-6 0 95147 gtex_brain_putamen_basal
RS10793279 11 77764871 ALG8 ENSG00000159063.8 2.186E-6 0 85835 gtex_brain_putamen_basal
RS35532994 11 77767930 ALG8 ENSG00000159063.8 5.992E-7 0 82776 gtex_brain_putamen_basal
RS35669928 11 77767948 ALG8 ENSG00000159063.8 6.065e-7 0 82758 gtex_brain_putamen_basal
RS6592762 11 77768117 ALG8 ENSG00000159063.8 3.474E-6 0 82589 gtex_brain_putamen_basal
RS7122205 11 77770232 ALG8 ENSG00000159063.8 6.929E-7 0 80474 gtex_brain_putamen_basal
RS11237372 11 77771253 ALG8 ENSG00000159063.8 1.231E-6 0 79453 gtex_brain_putamen_basal
RS11237374 11 77773926 ALG8 ENSG00000159063.8 1.237E-6 0 76780 gtex_brain_putamen_basal
RS17825572 11 77774017 ALG8 ENSG00000159063.8 1.237E-6 0 76689 gtex_brain_putamen_basal
RS2282639 11 77774599 ALG8 ENSG00000159063.8 1.237E-6 0 76107 gtex_brain_putamen_basal
RS10899435 11 77777019 ALG8 ENSG00000159063.8 1.246E-6 0 73687 gtex_brain_putamen_basal
RS9651743 11 77777188 ALG8 ENSG00000159063.8 1.246E-6 0 73518 gtex_brain_putamen_basal
RS9651744 11 77777402 ALG8 ENSG00000159063.8 4.135E-7 0 73304 gtex_brain_putamen_basal
RS10793281 11 77777821 ALG8 ENSG00000159063.8 4.432E-7 0 72885 gtex_brain_putamen_basal
RS10751280 11 77784380 ALG8 ENSG00000159063.8 1.345E-6 0 66326 gtex_brain_putamen_basal
RS11237378 11 77785453 ALG8 ENSG00000159063.8 5.03e-7 0 65253 gtex_brain_putamen_basal
RS61141394 11 77785536 ALG8 ENSG00000159063.8 1.237E-6 0 65170 gtex_brain_putamen_basal
RS12276887 11 77785626 ALG8 ENSG00000159063.8 4.615E-7 0 65080 gtex_brain_putamen_basal
RS12276891 11 77785645 ALG8 ENSG00000159063.8 1.334E-6 0 65061 gtex_brain_putamen_basal
RS11237379 11 77785957 ALG8 ENSG00000159063.8 1.237E-6 0 64749 gtex_brain_putamen_basal
RS2154963 11 77796139 ALG8 ENSG00000159063.8 1.194E-6 0 54567 gtex_brain_putamen_basal
RS10793284 11 77810806 ALG8 ENSG00000159063.8 3.725E-7 0 39900 gtex_brain_putamen_basal
RS10793285 11 77811196 ALG8 ENSG00000159063.8 3.725E-7 0 39510 gtex_brain_putamen_basal
RS1075202 11 77813207 ALG8 ENSG00000159063.8 1.293E-7 0 37499 gtex_brain_putamen_basal
RS71046955 11 77816764 ALG8 ENSG00000159063.8 5.399E-7 0 33942 gtex_brain_putamen_basal
RS10751281 11 77820168 ALG8 ENSG00000159063.8 3.725E-7 0 30538 gtex_brain_putamen_basal
RS10899440 11 77825275 ALG8 ENSG00000159063.8 3.727E-7 0 25431 gtex_brain_putamen_basal
RS72946531 11 77826985 ALG8 ENSG00000159063.8 3.907E-7 0 23721 gtex_brain_putamen_basal
RS12146488 11 77830048 ALG8 ENSG00000159063.8 4.97E-7 0 20658 gtex_brain_putamen_basal
RS144307072 11 77834060 ALG8 ENSG00000159063.8 2.725E-6 0 16646 gtex_brain_putamen_basal
RS140013289 11 77834078 ALG8 ENSG00000159063.8 3.082e-6 0 16628 gtex_brain_putamen_basal
RS61454279 11 77838011 ALG8 ENSG00000159063.8 4.984e-7 0 12695 gtex_brain_putamen_basal
RS12273235 11 77842614 ALG8 ENSG00000159063.8 1.777E-7 0 8092 gtex_brain_putamen_basal
RS10793287 11 77846706 ALG8 ENSG00000159063.8 2.008e-7 0 4000 gtex_brain_putamen_basal
RS10793289 11 77850517 ALG8 ENSG00000159063.8 5.97E-7 0 189 gtex_brain_putamen_basal
RS2156785 11 77850824 ALG8 ENSG00000159063.8 2.186E-6 0 -118 gtex_brain_putamen_basal
RS11237410 11 77851606 ALG8 ENSG00000159063.8 5.882e-7 0 -900 gtex_brain_putamen_basal
RS58463648 11 77852147 ALG8 ENSG00000159063.8 1.004E-6 0 -1441 gtex_brain_putamen_basal
RS7101694 11 77853896 ALG8 ENSG00000159063.8 2.431E-7 0 -3190 gtex_brain_putamen_basal
RS1263732 11 77858421 ALG8 ENSG00000159063.8 1.364E-6 0 -7715 gtex_brain_putamen_basal
RS1263727 11 77862719 ALG8 ENSG00000159063.8 1.46E-6 0 -12013 gtex_brain_putamen_basal
RS1263726 11 77864023 ALG8 ENSG00000159063.8 1.268E-6 0 -13317 gtex_brain_putamen_basal
RS977978 11 77865936 ALG8 ENSG00000159063.8 1.533E-6 0 -15230 gtex_brain_putamen_basal
RS4015965 11 77866882 ALG8 ENSG00000159063.8 3.595 e-6 0 -16176 gtex_brain_putamen_basal
RS1263578 11 77867049 ALG8 ENSG00000159063.8 1.428E-6 0 -16343 gtex_brain_putamen_basal
RS1263577 11 77869742 ALG8 ENSG00000159063.8 1.614 e-6 0 -19036 gtex_brain_putamen_basal
RS1151183 11 77870638 ALG8 ENSG00000159063.8 1.623E-6 0 -19932 gtex_brain_putamen_basal
RS28547 11 77872876 ALG8 ENSG00000159063.8 1.623E-6 0 -22170 gtex_brain_putamen_basal
RS230667 11 77877369 ALG8 ENSG00000159063.8 1.658E-6 0 -26663 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
0.68 0.47
Fam3a 0.67 0.62
马尔 0.66 0.45
忍者 0.66 0.48
elovl1 0.65 0.53
C12orf62 0.65 0.56
CAPN3 0.65 0.50
SNX22 0.65 0.58
inpp1 0.65 0.65
arl2 0.65 0.64
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PBX1 -0.32 -0.12
EPHB1 -0.32 -0.17
Sox4 -0.32 -0.23
XPR1 -0.32 -0.16
Robo1 -0.31 -0.10
Bcl11b -0.31 -0.06
ROBO2 -0.30 -0.09
gadl1 -0.30 -0.11
IGSF3 -0.30 -0.08
BRWD3 -0.29 -0.14

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg n glycan生物合成 46 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
蛋白质的反应组代谢 518 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome术后翻译蛋白修饰 188 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome天冬酰胺N连接的糖基化 81 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
N Glycan前体Dolichol脂质的寡糖LLO的Reactome生物合成并转移到新生蛋白 29 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser MYC靶向血清抑制 159 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌11q12 Q14 Amplicon 158 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Peng Leucine剥夺DN 187 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Magrangeas多发性骨髓瘤IgLL与IgLK DN 24 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血晚期祖先 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 281 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔内B 172 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fournier腺泡开发2 277 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gutierrez多发性骨髓瘤 35 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞DN 428 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因