基因页:C11orf49
概括?
基因 | 79096 |
象征 | C11orf49 |
同义词 | - |
描述 | 染色体11开放阅读框49 |
参考 | HGNC:HGNC:28720|Ensembl:ENSG00000149179|HPRD:08332|Vega:Otthumg00000166725 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11P11.2 |
Pascal P值 | 7.252E-4 |
Sherlock P值 | 0.986 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/C11orf49_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CBLN3 | 0.72 | 0.11 |
CDH15 | 0.54 | 0.27 |
Gabra6 | 0.52 | 0.15 |
SYTL1 | 0.40 | 0.13 |
mei1 | 0.33 | 0.07 |
SNCG | 0.28 | 0.11 |
itgb1bp3 | 0.28 | 0.08 |
SCN4A | 0.27 | 0.09 |
VWC2 | 0.27 | 0.09 |
SLC38A8 | 0.27 | 0.12 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SEC14L1 | -0.15 | -0.11 |
ZNF184 | -0.15 | -0.20 |
Smurf1 | -0.14 | -0.13 |
EXD2 | -0.14 | -0.13 |
Stard7 | -0.14 | -0.18 |
ZNF189 | -0.14 | -0.16 |
add1 | -0.14 | -0.13 |
UBE2Q2 | -0.14 | -0.20 |
PPP1R15B | -0.14 | -0.16 |
PEX12 | -0.14 | -0.13 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钟对偶氮丁丁和TSA DN的反应 | 70 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Appierto对Fenretinide DN的反应 | 51 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼转移 | 344 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |