基因页:DEK
概括?
基因 | 7913 |
象征 | DEK |
同义词 | D6S231E |
描述 | DEK原型癌基因 |
参考 | MIM:125264|HGNC:HGNC:2768|Ensembl:ENSG00000124795|HPRD:00503|Vega:Otthumg0000000014319 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6p22.3 |
Pascal P值 | 0.386 |
Sherlock P值 | 0.837 |
胎儿β | 1.662 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.033 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG23132254 | 6 | 18264719 | DEK | 2.869E-4 | -0.389 | 0.039 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DEK_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003677 | DNA结合 | IEA | - | |
去:0003704 | 特异性RNA聚合酶II转录因子活性 | 塔斯 | 9050861 | |
GO:0042393 | 组蛋白结合 | 艾达 | 12140263 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006357 | 调节RNA聚合酶II启动子的转录 | 塔斯 | 9050861 | |
去:0007165 | 信号转导 | 塔斯 | 9050861 | |
GO:0019079 | 病毒基因组复制 | 塔斯 | 9050861 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | 塔斯 | 9050861 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多恩乳腺癌类DN | 34 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林格伦膀胱癌群集3 | 329 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Markey RB1急性LOF DN | 228 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
受甲基化DN调节的Missiaglia | 122 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
myllykangas放大热点15 | 13 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Grasemann视网膜细胞瘤,具有6p扩增 | 14 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA XPRSS INT网络 | 168 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana BRCA2 PCC网络 | 423 | 265 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana BRCA中心网络 | 117 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
考夫曼黑色素瘤复发 | 61 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 | 165 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath ES 1 | 379 | 235 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath增殖 | 147 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath ES核心九相关 | 100 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Georges细胞周期miR192目标 | 62 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shen Smarca2目标 | 424 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
唱机转移基质DN | 54 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
考夫曼DNA复制基因 | 147 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌6p24 P22 Amplicon | 21 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
克莱因原发性积液淋巴瘤DN | 58 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shepard粉碎和燃烧突变体DN | 185 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭葡萄糖剥夺DN | 169 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cromer转移 | 79 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vernell视网膜母细胞瘤路径 | 70 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
welcsh brca1靶向 | 198 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mitsiades对aplidin DN的反应 | 249 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Qi Plasmacytoma Up | 259 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对Salirasib dn的Blum响应 | 342 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
格雷希克癌症复制号码 | 323 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer生存DN | 175 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标36小时DN | 185 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标60小时DN | 277 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标DN | 89 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BRCA1的Pujana乳腺癌突变 | 56 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S2 | 115 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gutierrez Waldenstroems大球蛋白血症2 | 13 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
全部复发预后 | 19 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤HP DN | 47 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄胚胎干细胞核心 | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1靶向衰老 | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标增长 | 243 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
IR响应6小时中的周细胞周期基因 | 85 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-138 | 62 | 68 | 1a | HSA-MIR-138脑 | Agcugguuguguugaauc |
mir-141/200a | 691 | 697 | M8 | HSA-MIR-141 | uaacacugucugugugugugaugg |
HSA-MIR-200A | uaacacugucuguguguguaaacgaugu | ||||
mir-181 | 73 | 79 | 1a | HSA-MIR-181A脑 | aacauucaacgcugucggugagu |
HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
mir-186 | 263 | 269 | 1a | HSA-MIR-186 | caaagaauuuugggcuu |
mir-214 | 123 | 129 | 1a | HSA-MIR-214脑 | acagcaggcacagacaggcag |
mir-330 | 766 | 772 | M8 | HSA-MIR-330脑 | GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA |
mir-381 | 601 | 607 | 1a | HSA-MIR-381 | uauacaagggcaagcucucugu |