基因页面:FAM134A
总结吗?
| GeneID | 79137年 |
| 象征 | FAM134A |
| 同义词 | C2orf17 |
| 描述 | 有序列相似性134个成员的家庭 |
| 参考 | HGNC: HGNC: 28450|运用:ENSG00000144567|HPRD: 12807|织女:OTTHUMG00000154577 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 2 q35 |
| 帕斯卡假定值 | 5.148 e-5 |
| 夏洛克假定值 | 0.197 |
| eGene | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 |
基因数据来源
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ITGB2 | 0.71 | 0.65 |
| CCR1 | 0.69 | 0.58 |
| CTSS | 0.69 | 0.59 |
| CSF1R | 0.68 | 0.64 |
| LAPTM5 | 0.68 | 0.61 |
| CYBB | 0.66 | 0.52 |
| CD4 | 0.66 | 0.63 |
| HCK | 0.66 | 0.58 |
| LPAR5 | 0.65 | 0.61 |
| SELPLG | 0.65 | 0.60 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AC005921.3 | -0.24 | -0.24 |
| ANP32C | -0.23 | -0.22 |
| RBMX2 | -0.22 | -0.23 |
| CLK1 | -0.22 | -0.23 |
| CIR1 | -0.22 | -0.21 |
| SNHG12 | -0.22 | -0.23 |
| AC145146.3 | -0.21 | -0.16 |
| RP9P | -0.21 | -0.26 |
| ANKRD36B | -0.21 | -0.22 |
| AC010300.1 | -0.21 | -0.17 |
第三部分。基因本体论注释
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 刘CMYB目标了 | 165年 | 106年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 刘VMYB目标了 | 127年 | 78年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN UDAYAKUMAR MED1目标 | 240年 | 171年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金赛的目标EWSR1 FLII融合DN | 329年 | 219年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王HCP前列腺癌 | 111年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布伊泰尔特说光动力治疗压力 | 811年 | 508年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里克曼转移了 | 344年 | 180年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马森FOXP3如果绑定 | 1229年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 约翰斯通PARVB目标3 | 430年 | 288年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| IVANOVSKA MIR106B目标 | 90年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PURBEY CTBP1和SATB1的目标 | 87年 | 52 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-125/351 | 354年 | 361年 | 1、m8 | hsa - mir - 125 b大脑 | UCCCUGAGACCCUAACUUGUGA |
| hsa - mir - 125 a大脑 | UCCCUGAGACCCUUUAACCUGUG | ||||
| mir - 142 - 5 - p | 409年 | 416年 | 1、m8 | hsa - mir - 142 - 5 - p | CAUAAAGUAGAAAGCACUAC |
| miR-15/16/195/424/497 | 366年 | 372年 | m8 | hsa-miR-15a大脑 | UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG |
| hsa-miR-16大脑 | UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG | ||||
| hsa-miR-15b大脑 | UAGCAGCACAUCAUGGUUUACA | ||||
| hsa - mir - 195深圳 | UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC | ||||
| hsa - mir - 424 | CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA | ||||
| hsa - mir - 497 | CAGCAGCACACUGUGGUUUGU | ||||
| miR-17-5p / 20/93.mr / 106/519.d | 407年 | 414年 | 1、m8 | hsa-miR-17-5p | CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU |
| hsa-miR-20a大脑 | UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG | ||||
| hsa - mir - 106 a | AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC | ||||
| hsa - mir - 106 b深圳 | UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU | ||||
| hsa-miR-20b深圳 | CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG | ||||
| hsa - mir - 519 d | CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU | ||||
| mir - 214 | 153年 | 159年 | m8 | hsa - mir - 214大脑 | ACAGCAGGCACAGACAGGCAG |