概括
基因 79139
象征 derl1
同义词 der-1 | der1
描述 德林1
参考 MIM:608813|HGNC:HGNC:28454|Ensembl:ENSG00000136986|HPRD:12302|Vega:Otthumg00000165080
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8Q24.13
Pascal P值 0.061
胎儿β 0.755
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG06201372 8 124054732 derl1 2.94e-10 -0.013 6.67E-7 DMG:JAFFE_2016
CG11668448 8 124054817 derl1 7.37E-8 -0.01 1.75e-5 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10894158 Chr11 129736156 derl1 79139 0.07 反式
RS1205088 CHR14 72282058 derl1 79139 0.13 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
fbl 0.85 0.75
EBF4 0.85 0.81
AC006273.1 0.81 0.76
FAM109A 0.81 0.80
COMTD1 0.81 0.69
B3GALT6 0.79 0.75
C20ORF195 0.78 0.64
MVD 0.78 0.72
Rac3 0.78 0.66
KCTD13 0.78 0.71
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C5orf53 -0.53 -0.53
AF347015.27 -0.52 -0.55
MT-CO2 -0.50 -0.55
ACOT13 -0.50 -0.54
S100B -0.50 -0.51
FAM162A -0.49 -0.54
AF347015.31 -0.49 -0.53
AF347015.33 -0.48 -0.52
AC021016.1 -0.48 -0.56
CA4 -0.48 -0.47

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG肌萎缩性侧索硬化症ALS 53 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村肿瘤区周围与中央 285 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vecchi胃癌先进与早期DN 138 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Landis乳腺癌进展DN 70 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Landis Erbb2乳腺肿瘤65 DN 37 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Landis Erbb2乳腺肿瘤324 DN 149 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 283 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori浆细胞向上 51 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌8Q23 Q24 AMPLICON 157 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
抗原演示中的pellicciotta HDAC DN 49 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林黑色素瘤复制号码 73 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin DN的反应 249 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌复制号 298 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A12 317 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Demagalhaes老化 55 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合的骨靶标 271 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Guillaumond KLF10靶向 51 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
山乳房干细胞DN 146 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因