基因页:derl1
概括?
基因 | 79139 |
象征 | derl1 |
同义词 | der-1 | der1 |
描述 | 德林1 |
参考 | MIM:608813|HGNC:HGNC:28454|Ensembl:ENSG00000136986|HPRD:12302|Vega:Otthumg00000165080 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8Q24.13 |
Pascal P值 | 0.061 |
胎儿β | 0.755 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG06201372 | 8 | 124054732 | derl1 | 2.94e-10 | -0.013 | 6.67E-7 | DMG:JAFFE_2016 |
CG11668448 | 8 | 124054817 | derl1 | 7.37E-8 | -0.01 | 1.75e-5 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10894158 | Chr11 | 129736156 | derl1 | 79139 | 0.07 | 反式 | ||
RS1205088 | CHR14 | 72282058 | derl1 | 79139 | 0.13 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DERL1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
fbl | 0.85 | 0.75 |
EBF4 | 0.85 | 0.81 |
AC006273.1 | 0.81 | 0.76 |
FAM109A | 0.81 | 0.80 |
COMTD1 | 0.81 | 0.69 |
B3GALT6 | 0.79 | 0.75 |
C20ORF195 | 0.78 | 0.64 |
MVD | 0.78 | 0.72 |
Rac3 | 0.78 | 0.66 |
KCTD13 | 0.78 | 0.71 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C5orf53 | -0.53 | -0.53 |
AF347015.27 | -0.52 | -0.55 |
MT-CO2 | -0.50 | -0.55 |
ACOT13 | -0.50 | -0.54 |
S100B | -0.50 | -0.51 |
FAM162A | -0.49 | -0.54 |
AF347015.31 | -0.49 | -0.53 |
AF347015.33 | -0.48 | -0.52 |
AC021016.1 | -0.48 | -0.56 |
CA4 | -0.48 | -0.47 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG肌萎缩性侧索硬化症ALS | 53 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村肿瘤区周围与中央 | 285 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vecchi胃癌先进与早期DN | 138 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Landis乳腺癌进展DN | 70 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Landis Erbb2乳腺肿瘤65 DN | 37 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Landis Erbb2乳腺肿瘤324 DN | 149 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 | 283 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mori浆细胞向上 | 51 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌8Q23 Q24 AMPLICON | 157 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
抗原演示中的pellicciotta HDAC DN | 49 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林黑色素瘤复制号码 | 73 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mitsiades对aplidin DN的反应 | 249 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Demagalhaes老化 | 55 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ewsr1 fli1融合的骨靶标 | 271 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Guillaumond KLF10靶向 | 51 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
山乳房干细胞DN | 146 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |