基因页面:LENG1

总结吗?
GeneID 79165年
象征 LENG1
同义词 - - - - - -
描述 白细胞受体集群(荣誉奖)成员1
参考 HGNC: HGNC: 15502|HPRD: 13985|
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 19 q13.4
帕斯卡假定值 0.043
胎儿β -0.175
eGene 迈尔斯的顺式和反式
支持 CompositeSet

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
认为:Fromer_2014 全外显子组测序分析 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。

部分即遗传学和表观遗传学注释

@认为表

基因 染色体 位置 裁判 Alt 成绩单 AA变化 突变类型 筛选 CG46 特征 研究
LENG1 chr19 54660649 C T NM_024316 p.143G >年代 错义 精神分裂症 认为:Fromer_2014

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs12061856 chr1 150001898 LENG1 79165年 0.17 反式
rs7530922 chr1 150023406 LENG1 79165年 0.14 反式
rs11205331 chr1 150104038 LENG1 79165年 0.13 反式
rs12124898 chr1 150154351 LENG1 79165年 0.13 反式
rs9967281 chr18 8999315 LENG1 79165年 0.08 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
SEMA3G 0.83 0.84
FLT1 0.83 0.84
PTPRB 0.82 0.83
ABCB1 0.81 0.81
COBLL1 0.81 0.82
EPAS1 0.81 0.84
MMRN2 0.81 0.83
GIMAP8 0.81 0.81
PTRF 0.81 0.84
A2M 0.79 0.80
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
ZNF32 -0.61 -0.71
SCNM1 -0.59 -0.65
COMMD3 -0.59 -0.65
NDUFAF2 -0.58 -0.66
POLB -0.57 -0.63
OXSM -0.57 -0.63
EXOSC8 -0.57 -0.65
ALKBH2 -0.56 -0.63
C18orf21 -0.56 -0.60
OCIAD2 -0.56 -0.60

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
由阿霉素GRAESSMANN细胞凋亡 1142年 669年 所有SZGR 2.0基因通路
GRAESSMANN MC和阿霉素 612年 367年 所有SZGR 2.0基因通路
BHATI G2M逮捕2 methoxyestradiol DN 127年 75年 所有SZGR 2.0基因通路
若林史江脂肪生成PPARG 8 d 658年 397年 所有SZGR 2.0基因通路