概括
基因 79175
象征 ZNF343
同义词 DJ734P14.5
描述 锌指蛋白343
参考 HGNC:HGNC:16017|Ensembl:ENSG00000088876|HPRD:18327|Vega:Otthumg0000000031701
基因类型 蛋白质编码
地图位置 20p13
Pascal P值 0.038
胎儿beta 0.903
DMG 1(#研究)
耶和华 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组关联研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136例对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG13236659 20 2490040 ZNF343 8.56e-9 -0.013 3.98E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 耶和华 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16829545 CHR2 151977407 ZNF343 79175 0.04 反式
RS16955618 CHR15 29937543 ZNF343 79175 0.09 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共同表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CCDC108 0.98 0.55
CCDC19 0.98 0.47
vwa3b 0.98 0.47
ARMC3 0.98 0.54
RP11-282K6.1 0.98 0.52
TCTEX1D1 0.97 0.59
WDR16 0.97 0.64
C3orf25 0.97 0.52
YSK4 0.97 0.47
DNAH9 0.97 0.60
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
IER5L -0.17 -0.41
NDRG1 -0.16 -0.22
Cidea -0.15 -0.27
SLC26A4 -0.15 -0.30
MEF2C -0.14 -0.32
EMX1 -0.14 -0.36
EPHB6 -0.14 -0.10
Arhgef2 -0.13 -0.18
GPR21 -0.13 -0.28
LNX1 -0.13 -0.16

V.途径注释

路径名 路径大小 #SZGR 2.0途径中的基因 信息
Reactome通用转录途径 352 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇3向上 170 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇6 140 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因