基因页:THTPA
概括?
基因 | 79178 |
象征 | THTPA |
同义词 | THTP | THTPase |
描述 | 硫胺三磷酸酶 |
参考 | MIM:611612|HGNC:HGNC:18987|ENSEMBL:ENSG00000259431|HPRD:15505|Vega:Otthumg00000172558 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 14Q11.2 |
Pascal P值 | 0.579 |
胎儿β | -0.618 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.047 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG03516708 | 14 | 24024880 | THTPA | 1.38e-9 | -0.027 | 1.37E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/THTPA_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004016 | 腺苷酸环化酶活性 | IEA | - | |
去:0050333 | 硫胺素三磷酸酶活性 | 艾达 | 11827967 | |
GO:0016787 | 水解酶活性 | 塔斯 | 11827967 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006171 | 营地生物合成过程 | IEA | - | |
去:0006091 | 产生前体代谢物和能量 | nas | 11827967 | |
去:0006772 | 硫胺素代谢过程 | 塔斯 | 11827967 | |
GO:0016311 | 去磷酸化 | 艾达 | 11827967 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005625 | 可溶性部分 | nas | 11827967 | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
维生素和辅因子的反应组代谢 | 51 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Buytaert光动力疗法应力DN | 637 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verhaak胶质母细胞瘤神经 | 129 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-218 | 292 | 298 | M8 | HSA-MIR-218脑 | uugugcuugaucuaaccaugu |
mir-31 | 308 | 314 | 1a | HSA-MIR-31 | Aggcaagaugcuggcauagcug |
mir-485-5p | 232 | 238 | M8 | HSA-MIR-485-5p | aggcuggccgugaugauuc |