概括
基因 79188
象征 TMEM43
同义词 arvc5 | arvd5 | edmd7 | luma
描述 跨膜蛋白43
参考 MIM:612048|HGNC:HGNC:28472|ENSEMBL:ENSG00000170876|HPRD:15541|Vega:Otthumg00000129802
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3P25.1
Pascal P值 0.485
Sherlock P值 0.82
胎儿β 0.876
DMG 1(#研究)
主持人 伏隔核基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.006

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG10608842 3 14166507 TMEM43 1.4e-9 -0.014 1.38e-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005794 高尔基体 艾达 11256614
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
中村肿瘤区周围与中央DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 391 222 该途径中的所有SZGR 2.0基因
thum收缩性心力衰竭 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LMO4靶向 372 227 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化CDC25 DN 153 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Castellano NRAS靶向 68 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Landis Erbb2乳腺肿瘤65 DN 37 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
landis erbb2乳房肿瘤型DN 55 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Landis Erbb2乳腺肿瘤324 DN 149 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗斯急性髓样白血病CBF 82 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROSS AML与AML1 ETO融合 76 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
松本自然杀手差分 475 313 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血晚期祖先 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild E2F3致癌特征 246 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durchdewald皮肤致癌DN 264 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN 238 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时 293 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasini suz12靶向DN 315 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-194 796 803 1A,M8 HSA-MIR-194 uguaacagcaacuccauga