基因页面:SLC39A7
总结吗?
| GeneID | 7922年 |
| 象征 | SLC39A7 |
| 同义词 | D6S115E | D6S2244E | H2-KE4 | HKE4 |课|戒指|大ZIP7 |
| 描述 | 溶质载体家庭39成员7 |
| 参考 | MIM: 601416|HGNC: HGNC: 4927|运用:ENSG00000112473|HPRD: 09028|织女:OTTHUMG00000031238 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 6 . 3 |
| 帕斯卡假定值 | 3.448的军医 |
| 夏洛克假定值 | 0.945 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.033 | |
| 表达式 | 荟萃分析的基因表达 | P值:1.642 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg11724493 | 6 | 33168040 | SLC39A7; RXRB基因 | 1.305的军医 | -0.25 | 0.03 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs11775998 | chr8 | 20189398 | SLC39A7 | 7922年 | 0.09 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 17353931 | |
| 去:0008270 | 锌离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0046873 | 金属离子跨膜转运体活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0030001 | 金属离子传输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006829 | 锌离子传输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006811 | 离子传输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005624 | 膜分数 | 助教 | 8812499 | |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| REACTOME小分子的跨膜运输 | 413年 | 270年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME SLC介导的跨膜运输 | 241年 | 157年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME运输的葡萄糖和其他糖胆汁盐和有机酸金属离子和胺化合物 | 89年 | 54 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME锌转运蛋白 | 15 | 9 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME金属离子SLC转运蛋白 | 22 | 13 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 父母MTOR信号了 | 567年 | 375年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 唐克斯的目标RUNX1 RUNX1T1单核细胞融合 | 204年 | 140年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素GRAESSMANN细胞凋亡 | 1142年 | 669年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MARTORIATI MDM4目标神经上皮 | 176年 | 111年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SPIELMAN淋巴母细胞欧洲和亚洲 | 479年 | 299年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN NUYTTEN EZH2目标 | 1024年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH MYC最大目标 | 775年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿米特20 MCF10A EGF响应 | 14 | 9 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 不知道背景目标1 | 140年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 挞挞浆细胞VS PLASMABLAST DN | 309年 | 206年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒18人力资源 | 178年 | 111年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN WELCSH BRCA1目标 | 141年 | 92年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KYNG过氧化氢反应 | 71年 | 42 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米利伪足趋化性DN | 457年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米利伪足趋触性DN | 668年 | 419年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 党受MYC | 1103年 | 714年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 么时间响应黄体酮集群14 | 143年 | 86年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 格鲁MIR16目标 | 206年 | 127年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PURBEY CTBP1不是SATB1 DN的目标 | 448年 | 282年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-125/351 | 393年 | 399年 | 1 | hsa - mir - 125 b大脑 | UCCCUGAGACCCUAACUUGUGA |
| hsa - mir - 125 a大脑 | UCCCUGAGACCCUUUAACCUGUG | ||||