基因页:RSG1
概括?
基因 | 79363 |
象征 | RSG1 |
同义词 | C1orf89 |
描述 | REM2和RAB像小GTPase 1 |
参考 | HGNC:HGNC:28127|ENSEMBL:ENSG00000132881|HPRD:14399|Vega:Otthumg00000002214 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p36.13 |
Pascal P值 | 0.017 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7370564 | 0 | C1orf89 | 79363 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RSG1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
EPB41L1 | 0.86 | 0.89 |
Magee1 | 0.85 | 0.88 |
ABR | 0.85 | 0.88 |
MAPK8IP3 | 0.85 | 0.85 |
马德 | 0.85 | 0.87 |
Plekha6 | 0.85 | 0.89 |
nos1ap | 0.85 | 0.86 |
PGBD5 | 0.84 | 0.86 |
Zer1 | 0.84 | 0.83 |
STXBP1 | 0.84 | 0.86 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.51 | -0.45 |
GNG11 | -0.51 | -0.55 |
C1orf54 | -0.49 | -0.52 |
C1orf61 | -0.46 | -0.54 |
PLA2G5 | -0.46 | -0.40 |
myl12a | -0.46 | -0.55 |
Rab13 | -0.45 | -0.53 |
AF347015.31 | -0.45 | -0.42 |
MT-CO2 | -0.45 | -0.42 |
Impa2 | -0.45 | -0.50 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
巨噬细胞的库马尔病原体负荷 | 275 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |