基因页面:LRFN3
总结吗?
| GeneID | 79414年 |
| 象征 | LRFN3 |
| 同义词 | FIGLER1 | SALM4 |
| 描述 | 富亮氨酸重复和纤连蛋白类型III域包含3 |
| 参考 | MIM: 612809|HGNC: HGNC: 28370|运用:ENSG00000126243|HPRD: 14309| |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 19 q13.12 |
| 帕斯卡假定值 | 0.256 |
| 夏洛克假定值 | 0.825 |
| 胎儿β | -0.616 |
| DMG | 2(#研究) |
| 支持 | Ascano FMRP目标 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Montano_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括172复制与精神分裂症之间的联系论文认定。 | 4 |
| DMG: vanEijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括432个不同甲基化CpG网站对应391精神分裂症患者之间独特的成绩单(n = 260)和对照组(n = 250)的影响。 | 4 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg09778958 | 19 | 36427721 | LRFN3 | 1.46的军医 | -0.006 | 0.139 | DMG: Montano_2016 |
| cg00739120 | 19 | 36035875 | LRFN3 | 1.318的军医 | 5.762 | DMG: vanEijk_2014 | |
| cg03548857 | 19 | 35940174 | LRFN3 | 8.31 e-5 | 4.738 | DMG: vanEijk_2014 | |
| cg08539991 | 19 | 36203832 | LRFN3 | 6.62 e-8 | -5.437 | DMG: vanEijk_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MTCP1NB | 0.81 | 0.73 |
| IMMP1L | 0.78 | 0.74 |
| MORN2 | 0.78 | 0.77 |
| rp11 - 884 k10.1 | 0.77 | 0.70 |
| MRPS28 | 0.77 | 0.70 |
| UBL5 | 0.76 | 0.66 |
| TMBIM4 | 0.76 | 0.66 |
| C8orf59 | 0.76 | 0.67 |
| TMEM126A | 0.75 | 0.63 |
| PXMP3 | 0.75 | 0.70 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| LRP1恰巧 | -0.53 | -0.50 |
| SLC6A6 | -0.52 | -0.50 |
| MLL2 | -0.52 | -0.53 |
| ATN1 | -0.51 | -0.49 |
| MYO18A | -0.51 | -0.44 |
| TULP4 | -0.50 | -0.48 |
| SRCAP | -0.50 | -0.49 |
| HERC2 | -0.50 | -0.47 |
| NDST1 | -0.50 | -0.45 |
| MPRIP | -0.50 | -0.46 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| NUYTTEN EZH2的目标了 | 1037年 | 673年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH NANOG目标 | 988年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH OCT4目标 | 290年 | 172年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH SOX2目标 | 734年 | 436年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH号目标 | 179年 | 105年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马顿斯维甲酸反应了 | 857年 | 456年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 经典VERHAAK胶质母细胞瘤 | 162年 | 122年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 促进DN KDM1A目标 | 211年 | 119年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |