基因页面:FAM65A
总结吗?
GeneID | 79567年 |
象征 | FAM65A |
同义词 | - - - - - - |
描述 | 有序列相似性65个成员的家庭 |
参考 | HGNC: HGNC: 25836|运用:ENSG00000039523|HPRD: 08586|织女:OTTHUMG00000137536 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 16 q22.1 |
帕斯卡假定值 | 0.003 |
夏洛克假定值 | 0.432 |
胎儿β | -0.3 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
支持 | CompositeSet 达内尔FMRP目标 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg04185041 | 16 | 67564545 | FAM65A | 2.263的军医 | 0.361 | 0.036 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs10516594 | chr4 | 114237566 | FAM65A | 79567年 | 0.15 | 反式 | ||
rs4497566 | chr13 | 51694324 | FAM65A | 79567年 | 0.15 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FAM65A_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KDM5B | 0.98 | 0.95 |
叫做PBRM1 | 0.97 | 0.96 |
C9orf97 | 0.97 | 0.94 |
ATF7IP | 0.97 | 0.97 |
CEP170 | 0.97 | 0.94 |
NUP160 | 0.96 | 0.94 |
SLAIN2 | 0.96 | 0.94 |
RBM12 | 0.96 | 0.96 |
C2orf44 | 0.96 | 0.92 |
ZBTB5 | 0.96 | 0.95 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C5orf53 | -0.71 | -0.79 |
HLA-F | -0.70 | -0.78 |
AIFM3 | -0.69 | -0.78 |
PTH1R | -0.68 | -0.75 |
S100B | -0.67 | -0.83 |
FBXO2 | -0.67 | -0.64 |
FXYD1 | -0.67 | -0.89 |
AF347015.31 | -0.67 | -0.87 |
TSC22D4 | -0.67 | -0.78 |
TNFSF12 | -0.66 | -0.67 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
FULCHER凝集素与炎症反应有限合伙人DN | 463年 | 290年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
王CLIM2目标了 | 269年 | 146年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MULLIGHAN MLL签名1 DN | 242年 | 165年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MULLIGHAN MLL签名2 DN | 281年 | 186年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金正日WT1目标8小时 | 164年 | 122年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金正日WT1目标12小时 | 162年 | 116年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由阿霉素GRAESSMANN细胞凋亡 | 1142年 | 669年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GRAESSMANN MC和阿霉素 | 612年 | 367年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
布伊泰尔特说光动力治疗压力 | 811年 | 508年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH SUZ12目标 | 1038年 | 678年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
布朗骨髓细胞发展DN | 129年 | 86年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
崔TCF21目标2 DN | 830年 | 547年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CREIGHTON内分泌治疗抵抗5 | 482年 | 296年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MASSARWEH他莫昔芬耐了 | 578年 | 341年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
60张及目标的人力资源 | 293年 | 203年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
陈代谢症侯群网络 | 1210年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森ES与H3K4ME3 ICP | 718年 | 401年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
约翰斯通PARVB目标3 | 430年 | 288年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
棕熊短波紫外线反应通过TP53集团 | 898年 | 516年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
若林史江脂肪生成PPARG RXRA 8 d | 882年 | 506年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
不是通过P38冯氏TNF响应 | 337年 | 236年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
VANOEVELEN肌发生SIN3A目标 | 220年 | 133年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |