基因页:ACSS3
概括?
基因 | 79611 |
象征 | ACSS3 |
同义词 | - |
描述 | 酰基-COA合成酶短链家庭成员3 |
参考 | MIM:614356|HGNC:HGNC:24723|Ensembl:ENSG00000111058|HPRD:13385|Vega:Otthumg00000170179 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 12Q21.31 |
Pascal P值 | 0.226 |
胎儿β | -1.525 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG11659501 | 12 | 81471678 | ACSS3 | 4.39e-9 | -0.015 | 2.6e-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7132043 | CHR12 | 80968399 | ACSS3 | 79611 | 0.18 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ACSS3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TMC6 | 0.93 | 0.88 |
PLXNB3 | 0.92 | 0.93 |
sema3b | 0.92 | 0.88 |
ATPGD1 | 0.92 | 0.92 |
PCTK3 | 0.92 | 0.88 |
TFEB | 0.91 | 0.88 |
GSN | 0.90 | 0.88 |
UAP1L1 | 0.90 | 0.88 |
LDB3 | 0.89 | 0.89 |
ldlrap1 | 0.89 | 0.85 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
polb | -0.63 | -0.75 |
GSTA4 | -0.62 | -0.70 |
IFT52 | -0.62 | -0.71 |
nkiras2 | -0.62 | -0.64 |
zbed5 | -0.61 | -0.72 |
RARS2 | -0.61 | -0.69 |
trnau1ap | -0.61 | -0.68 |
tubb2b | -0.61 | -0.66 |
HN1 | -0.60 | -0.69 |
FRG1 | -0.60 | -0.72 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg丙酸代谢 | 33 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌与LMP1 DN | 175 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wamunyokoli卵巢癌LMP DN | 199 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌根源与基础 | 330 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向DN | 314 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄达沙替尼抵抗DN | 69 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G6 UP | 65 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌子类CTNNB1 UP | 176 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤 | 207 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Noushmehr GBM被甲基化沉默 | 50 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verhaak胶质母细胞瘤经典 | 162 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2同工型的Pedersen转移7 | 403 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |