概括
基因 79611
象征 ACSS3
同义词 -
描述 酰基-COA合成酶短链家庭成员3
参考 MIM:614356|HGNC:HGNC:24723|Ensembl:ENSG00000111058|HPRD:13385|Vega:Otthumg00000170179
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12Q21.31
Pascal P值 0.226
胎儿β -1.525
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG11659501 12 81471678 ACSS3 4.39e-9 -0.015 2.6e-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7132043 CHR12 80968399 ACSS3 79611 0.18 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TMC6 0.93 0.88
PLXNB3 0.92 0.93
sema3b 0.92 0.88
ATPGD1 0.92 0.92
PCTK3 0.92 0.88
TFEB 0.91 0.88
GSN 0.90 0.88
UAP1L1 0.90 0.88
LDB3 0.89 0.89
ldlrap1 0.89 0.85
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
polb -0.63 -0.75
GSTA4 -0.62 -0.70
IFT52 -0.62 -0.71
nkiras2 -0.62 -0.64
zbed5 -0.61 -0.72
RARS2 -0.61 -0.69
trnau1ap -0.61 -0.68
tubb2b -0.61 -0.66
HN1 -0.60 -0.69
FRG1 -0.60 -0.72

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg丙酸代谢 33 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌与LMP1 DN 175 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wamunyokoli卵巢癌LMP DN 199 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与基础 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向DN 314 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄达沙替尼抵抗DN 69 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G6 UP 65 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌子类CTNNB1 UP 176 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤 207 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Noushmehr GBM被甲基化沉默 50 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verhaak胶质母细胞瘤经典 162 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2同工型的Pedersen转移7 403 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因