基因页：C1orf54
概括？
| 基因 | 79630 |
| 象征 | C1orf54 |
| 同义词 | - |
| 描述 | 染色体1开放阅读框54 |
| 参考 | HGNC：HGNC：26258|ENSEMBL：ENSG00000118292|HPRD：08020|Vega：Otthumg0000000012546 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1q21.2 |
| Sherlock P值 | 0.648 |
| 胎儿β | -0.788 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0235 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.00814 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS10116858 | Chr9 | 20300988 | C1orf54 | 79630 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C6orf59 | 0.88 | 0.74 |
| Med31 | 0.88 | 0.66 |
| COX7A2 | 0.88 | 0.77 |
| NDUFB6 | 0.87 | 0.78 |
| MRPL33 | 0.86 | 0.63 |
| MDP1 | 0.85 | 0.68 |
| C14orf2 | 0.85 | 0.65 |
| MRPS28 | 0.84 | 0.69 |
| CMC1 | 0.84 | 0.56 |
| Hint1 | 0.84 | 0.74 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Caskin2 | -0.42 | -0.51 |
| myh9 | -0.42 | -0.37 |
| mtss1l | -0.41 | -0.41 |
| AC020763.2 | -0.38 | -0.38 |
| SLC27A1 | -0.38 | -0.43 |
| mmrn2 | -0.38 | -0.38 |
| Notch3 | -0.38 | -0.46 |
| tenc1 | -0.37 | -0.48 |
| TLN1 | -0.37 | -0.42 |
| FAM38A | -0.37 | -0.46 |
第三节。基因本体论注释
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005576 | 细胞外区域 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Schuetz乳腺癌导管侵入性 | 351 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn | 493 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Davicioni分子臂与ERMS DN | 182 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 胶原蛋白凝胶DN中的Oswald造血干细胞 | 275 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 莱茵所有糖皮质激素治疗DN | 362 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan mll签名1 | 380 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 | 329 | 219 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gaussmann MLL AF4融合靶向F | 185 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HBV感染的Wieland | 101 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53靶向 | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 华莱士前列腺癌竞赛 | 299 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bhati G2M被2methoxyestradiol DN逮捕 | 127 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Valk AML群集16 | 26 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Valk AML，11q23重新排列 | 22 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF LCP带有H3K4ME3 | 128 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen IPS LCP带有H3K4Me3 | 174 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES LCP带有H3K4Me3 | 142 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC LCP带有H3K4ME3 | 58 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Verhaak胶质母细胞瘤间充质 | 216 | 130 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHYLA CBFA2T3靶向 | 387 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Huang Gata2靶向 | 149 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |