基因页：ARMC7
概括？
| 基因 | 79637 |
| 象征 | ARMC7 |
| 同义词 | - |
| 描述 | Armadillo重复包含7 |
| 参考 | HGNC：HGNC：26168|ENSEMBL：ENSG00000125449|HPRD：08649|Vega：Otthumg00000179345 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 17q25.1 |
| Pascal P值 | 0.057 |
| Sherlock P值 | 0.804 |
| 胎儿β | -0.28 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 小脑 额叶皮质BA9 海马 伏隔核基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG26129916 | 17 | 73258208 | ARMC7 | 4.789E-4 | 3.166 | DMG：Vaneijk_2014 | |
| CG23727583 | 17 | 72869061 | ARMC7 | 1.343E-4 | 2.619 | DMG：Vaneijk_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS16829545 | CHR2 | 151977407 | ARMC7 | 79637 | 7.387E-4 | 反式 | ||
| RS3845734 | CHR2 | 171125572 | ARMC7 | 79637 | 0 | 反式 | ||
| RS7584986 | CHR2 | 184111432 | ARMC7 | 79637 | 0.1 | 反式 | ||
| RS2183142 | CHR4 | 159232695 | ARMC7 | 79637 | 0.06 | 反式 | ||
| RS17762315 | CHR5 | 76807576 | ARMC7 | 79637 | 7.797E-4 | 反式 | ||
| RS7787830 | CHR7 | 98797019 | ARMC7 | 79637 | 0.06 | 反式 | ||
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | ARMC7 | 79637 | 1.714E-4 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C1orf149 | 0.90 | 0.89 |
| CDK8 | 0.89 | 0.88 |
| C9orf30 | 0.89 | 0.89 |
| MRPL3 | 0.88 | 0.88 |
| ARMCX1 | 0.88 | 0.90 |
| dync1li1 | 0.88 | 0.88 |
| dym | 0.88 | 0.88 |
| Rab11a | 0.88 | 0.87 |
| tada1l | 0.87 | 0.88 |
| BFAR | 0.87 | 0.87 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CO2 | -0.76 | -0.81 |
| AF347015.33 | -0.75 | -0.81 |
| AF347015.8 | -0.75 | -0.82 |
| AF347015.27 | -0.75 | -0.81 |
| mt-cyb | -0.74 | -0.81 |
| AF347015.26 | -0.74 | -0.81 |
| AF347015.15 | -0.73 | -0.82 |
| AF347015.2 | -0.73 | -0.81 |
| AF347015.31 | -0.72 | -0.79 |
| HLA-F | -0.72 | -0.77 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和阿霉素的反应 | 612 | 367 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lastowska神经母细胞瘤复制编号 | 181 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon | 335 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BHAT ESR1不是通过AKT1 DN的目标 | 88 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang EGF间隔DN | 214 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |