基因页:HSPBAP1
概括?
基因 | 79663 |
象征 | HSPBAP1 |
同义词 | PASS1 |
描述 | HSPB1相关蛋白1 |
参考 | MIM:608263|HGNC:HGNC:16389|ENSEMBL:ENSG00000169087|HPRD:12197|Vega:Otthumg00000159550 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3Q21.1 |
Pascal P值 | 0.044 |
Sherlock P值 | 0.798 |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 额叶皮质BA9 伏隔核基底神经节 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS35399710 | 3 | 122584413 | HSPBAP1 | ENSG00000169087.6 | 2.7637E-7 | 0 | -71742 | gtex_brain_ba24 |
RS12494271 | 3 | 122585784 | HSPBAP1 | ENSG00000169087.6 | 2.87783E-6 | 0 | -73113 | gtex_brain_ba24 |
RS6438769 | 3 | 122605701 | HSPBAP1 | ENSG00000169087.6 | 2.87783E-6 | 0 | -93030 | gtex_brain_ba24 |
RS2116320 | 3 | 122610558 | HSPBAP1 | ENSG00000169087.6 | 2.88227E-6 | 0 | -97887 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/HSPBAP1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Ginestier乳腺癌20Q13扩增DN | 180 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
UDayakumar Med1靶向DN | 240 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
狮子有Sox4结合位点 | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标 | 212 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC MYC目标 | 217 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标需要MYC | 210 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |