基因页面:C3orf52
总结吗?
| GeneID | 79669年 |
| 象征 | C3orf52 |
| 同义词 | TTMP |
| 描述 | 染色体3开放阅读框52 |
| 参考 | MIM: 611956|HGNC: HGNC: 26255|运用:ENSG00000114529|HPRD: 08018|织女:OTTHUMG00000159230 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 3 q13.2 |
| 帕斯卡假定值 | 0.018 |
| 胎儿β | -0.739 |
| DMG | 2(#研究) |
| eGene | 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了DNA的甲基化概要首发精神分裂症患者外周血细胞从18岁(FESZ)和15名正常对照组。 | 2 |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
| GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.04359 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.04047 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg04945395 | 3 | 111805408 | C3orf52 | 2.724的军医 | -0.472 | 0.038 | DMG: Wockner_2014 |
| cg06807989 | 3 | 111805312 | C3orf52 | -0.027 | 0.3 | DMG: Nishioka_2013 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs4077565 | chr3 | 110932325 | C3orf52 | 79669年 | 0.17 | 独联体 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SPATA18 | 0.99 | 0.38 |
| ARMC3 | 0.99 | 0.59 |
| C6orf97 | 0.98 | 0.45 |
| TEKT1 | 0.98 | 0.57 |
| YSK4 | 0.98 | 0.57 |
| C9orf171 | 0.98 | 0.54 |
| ARMC4 | 0.98 | 0.47 |
| CCDC108 | 0.98 | 0.57 |
| TTC29 | 0.98 | 0.52 |
| FAM166B | 0.98 | 0.46 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| NDRG1 | -0.13 | -0.17 |
| SLC26A4 | -0.13 | -0.30 |
| CIDEA | -0.13 | -0.30 |
| FBXO32 | -0.12 | -0.02 |
| MGLL | -0.12 | -0.11 |
| IER5L | -0.12 | -0.27 |
| KCNV1 | -0.11 | -0.16 |
| CCKBR | -0.11 | -0.11 |
| CAMKK2 | -0.11 | -0.10 |
| EPHB6 | -0.11 | -0.10 |
第三部分。基因本体论注释
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005789 | 内质网的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005783 | 内质网 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 钟阿扎胞苷和TSA | 183年 | 119年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DAVICIONI PAX FOXO1融合DN的目标 | 68年 | 49 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 森古普塔和LMP1鼻咽癌 | 408年 | 247年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CASORELLI急性早幼粒细胞白血病DN | 663年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ODONNELL TFRC目标了 | 456年 | 228年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李神经嵴干细胞 | 146年 | 99年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 长岛NRG1信号了 | 176年 | 123年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金正日WT1目标了 | 214年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| WAMUNYOKOLI卵巢癌LMP | 265年 | 158年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| WAMUNYOKOLI卵巢癌成绩1 2 | 137年 | 84年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗德里格斯甲状腺癌分化不良DN | 805年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 乳腺癌顶浆分泌与腔的农民 | 326年 | 213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN MOHANKUMAR TLX1目标 | 193年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| WATTEL自治甲状腺腺瘤 | 73年 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SHETH肝癌VS TXNIP PAM1损失 | 229年 | 137年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NUYTTEN EZH2的目标了 | 1037年 | 673年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布伊泰尔特说光动力治疗压力 | 811年 | 508年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿米特120 MCF10A血清反应 | 65年 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 张IKK抑制剂和肿瘤坏死因子 | 223年 | 140年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MANALO缺氧DN | 289年 | 166年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO和H3K27ME3肝癌 | 295年 | 149年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MITSIADES APLIDIN反应 | 439年 | 257年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 萧述三乳腺癌基本DN | 701年 | 446年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李双极性胸腺细胞 | 27 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陈代谢症侯群网络 | 1210年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森ES与H3K4ME3 ICP | 718年 | 401年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN WIERENGA STAT5A目标 | 213年 | 127年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KOINUMA SMAD2或SMAD3的目标 | 824年 | 528年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 皮德森转移由ERBB2同种型7 | 403年 | 240年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 他的目标611 ERBB2的清洁技术基金对碘氧基苯甲醚 | 76年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN FORTSCHEGGER PHF8目标 | 784年 | 464年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 冯氏TNF通过P38部分反应 | 160年 | 106年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GHANDHI直接照射 | 110年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZWANG 3班是暂时性的EGF引起的 | 222年 | 159年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |