基因页:ZCCHC6
概括?
基因 | 79670 |
象征 | ZCCHC6 |
同义词 | papd6 | tut7 |
描述 | 锌指CCHC型包含6个 |
参考 | MIM:613467|HGNC:HGNC:25817|Ensembl:ENSG00000083223|HPRD:11697|Vega:Otthumg00000020137 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 9Q21 |
Pascal P值 | 0.001 |
Sherlock P值 | 0.409 |
主持人 | 梭子基底神经节 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
表达 | 基因表达的荟萃分析 | p价值:1.354 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2812003 | 9 | 88743556 | ZCCHC6 | ENSG00000083223.13 | 1.54851E-6 | 0.02 | 225813 | gtex_brain_putamen_basal |
RS79680078 | 9 | 88755914 | ZCCHC6 | ENSG00000083223.13 | 2.1438E-6 | 0.02 | 213455 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11141262 | 9 | 88756246 | ZCCHC6 | ENSG00000083223.13 | 2.10631E-6 | 0.02 | 213123 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11141263 | 9 | 88757758 | ZCCHC6 | ENSG00000083223.13 | 1.95235E-6 | 0.02 | 211611 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11141273 | 9 | 88772152 | ZCCHC6 | ENSG00000083223.13 | 4.94305E-6 | 0.02 | 197217 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZCCHC6_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003676 | 核酸结合 | IEA | - | |
GO:0016779 | 核苷基转移酶活性 | IEA | - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Bidus转移DN | 161 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
liang造血细胞数大与微小的DN | 45 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mori前BI淋巴细胞DN | 77 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sarrio上皮间质转变DN | 154 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mitsiades对aplidin的反应 | 439 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chen Hoxa5靶向9小时 | 223 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤课程DN | 210 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
尼尔森·吉斯特(Nielsen Gist) | 98 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过p38完成的phong TNF响应 | 227 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ghandhi旁观者辐照 | 86 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |