概括
基因 79670
象征 ZCCHC6
同义词 papd6 | tut7
描述 锌指CCHC型包含6个
参考 MIM:613467|HGNC:HGNC:25817|Ensembl:ENSG00000083223|HPRD:11697|Vega:Otthumg00000020137
基因类型 蛋白质编码
地图位置 9Q21
Pascal P值 0.001
Sherlock P值 0.409
主持人 梭子基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:1.354

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2812003 9 88743556 ZCCHC6 ENSG00000083223.13 1.54851E-6 0.02 225813 gtex_brain_putamen_basal
RS79680078 9 88755914 ZCCHC6 ENSG00000083223.13 2.1438E-6 0.02 213455 gtex_brain_putamen_basal
RS11141262 9 88756246 ZCCHC6 ENSG00000083223.13 2.10631E-6 0.02 213123 gtex_brain_putamen_basal
RS11141263 9 88757758 ZCCHC6 ENSG00000083223.13 1.95235E-6 0.02 211611 gtex_brain_putamen_basal
RS11141273 9 88772152 ZCCHC6 ENSG00000083223.13 4.94305E-6 0.02 197217 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003676 核酸结合 IEA -
GO:0016779 核苷基转移酶活性 IEA -
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Bidus转移DN 161 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
liang造血细胞数大与微小的DN 45 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori前BI淋巴细胞DN 77 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sarrio上皮间质转变DN 154 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin的反应 439 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen Hoxa5靶向9小时 223 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤课程DN 210 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼尔森·吉斯特(Nielsen Gist) 98 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38完成的phong TNF响应 227 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rattenbacher由Celf1绑定 467 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ghandhi旁观者辐照 86 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因