基因页面:FN3KRP
总结吗?
| GeneID | 79672年 |
| 象征 | FN3KRP |
| 同义词 | FN3KL |
| 描述 | 果糖胺3激酶相关蛋白质 |
| 参考 | MIM: 611683|HGNC: HGNC: 25700|运用:ENSG00000141560|HPRD: 13546|织女:OTTHUMG00000177846 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 17 q25.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.331 |
| 夏洛克假定值 | 0.889 |
| 胎儿β | -0.032 |
| eGene | 前扣带皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马体 下丘脑 伏隔核基底神经节 硬膜基底神经节 元 |
| 支持 | CompositeSet |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| 认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| FN3KRP | chr17 | 80676833 | 一个 | G | NM_024619 NR_046408 |
p.65T >一 。 |
错义 npcRNA |
精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs2280251 | 17 | 80675105 | FN3KRP | ENSG00000141560.10 | 4.061 e - | 0.01 | 546年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7207719 | 17 | 80676971 | FN3KRP | ENSG00000141560.10 | 3.806 e - | 0.01 | 2412年 | gtex_brain_ba24 |
| rs58867683 | 17 | 80679455 | FN3KRP | ENSG00000141560.10 | 4.09 e - | 0.01 | 4896年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2246577 | 17 | 80680394 | FN3KRP | ENSG00000141560.10 | 2.994 e - | 0.01 | 5835年 | gtex_brain_ba24 |
| rs3748812 | 17 | 80680589 | FN3KRP | ENSG00000141560.10 | 5.748 e - | 0.01 | 6030年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2280251 | 17 | 80675105 | FN3KRP | ENSG00000141560.10 | 1.619 e-9 | 0 | 546年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7207719 | 17 | 80676971 | FN3KRP | ENSG00000141560.10 | 1.215 e - | 0 | 2412年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10630775 | 17 | 80678631 | FN3KRP | ENSG00000141560.10 | 2.151 e - | 0 | 4072年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs58867683 | 17 | 80679455 | FN3KRP | ENSG00000141560.10 | 6.803 e-11 | 0 | 4896年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2246577 | 17 | 80680394 | FN3KRP | ENSG00000141560.10 | 2.841 e-9 | 0 | 5835年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3748812 | 17 | 80680589 | FN3KRP | ENSG00000141560.10 | 2.378 e - | 0 | 6030年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2257084 | 17 | 80687475 | FN3KRP | ENSG00000141560.10 | 3.845 e - | 0 | 12916年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs71168143 | 17 | 80687606 | FN3KRP | ENSG00000141560.10 | 4.448 e-8 | 0 | 13047年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2256833 | 17 | 80689667 | FN3KRP | ENSG00000141560.10 | 6.628 e-8 | 0 | 15108年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2459703 | 17 | 80690632 | FN3KRP | ENSG00000141560.10 | 1.644 e - | 0 | 16073年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3859206 | 17 | 80693128 | FN3KRP | ENSG00000141560.10 | 9.342 e - | 0 | 18569年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3848403 | 17 | 80693899 | FN3KRP | ENSG00000141560.10 | 4.014 e - | 0 | 19340年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3859207 | 17 | 80694399 | FN3KRP | ENSG00000141560.10 | 3.47 e - | 0 | 19840年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs8067360 | 17 | 80694826 | FN3KRP | ENSG00000141560.10 | 3.516 e - | 0 | 20267年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs8082558 | 17 | 80695501 | FN3KRP | ENSG00000141560.10 | 4.905 e-8 | 0 | 20942年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2263122 | 17 | 80697773 | FN3KRP | ENSG00000141560.10 | 7.94 e-9 | 0 | 23214年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 金正日WT1目标了 | 214年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NIKOLSKY乳腺癌17 Q25对方篮里扩增子 | 335年 | 181年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝脏肿瘤旁正常组织DN | 354年 | 216年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝癌DN | 540年 | 340年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PURBEY CTBP1和SATB1 DN的目标 | 180年 | 116年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN FORTSCHEGGER PHF8目标 | 784年 | 464年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |