基因页面:FASTKD1
总结吗?
GeneID | 79675年 |
象征 | FASTKD1 |
同义词 | - - - - - - |
描述 | 快激酶域1 |
参考 | HGNC: HGNC: 26150|运用:ENSG00000138399|HPRD: 07969|织女:OTTHUMG00000154953 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 2问 |
帕斯卡假定值 | 0.155 |
夏洛克假定值 | 0.116 |
胎儿β | 0.434 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 尾状基底神经节 小脑 下丘脑 伏隔核基底神经节 硬膜基底神经节 元 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg23928435 | 2 | 170430788 | FASTKD1 | 3.672的军医 | 0.442 | 0.042 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs112651521 | 2 | 170346004 | FASTKD1 | ENSG00000138399.13 | 7.701 e-8 | 0 | 84381年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs7349274 | 2 | 170386294 | FASTKD1 | ENSG00000138399.13 | 2.144 e-8 | 0 | 44091年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs73037961 | 2 | 170389032 | FASTKD1 | ENSG00000138399.13 | 2.144 e-8 | 0 | 41353年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs16857020 | 2 | 170390189 | FASTKD1 | ENSG00000138399.13 | 2.144 e-8 | 0 | 40196年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs79371451 | 2 | 170399190 | FASTKD1 | ENSG00000138399.13 | 1.596 e-8 | 0 | 31195年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs12470809 | 2 | 170401673 | FASTKD1 | ENSG00000138399.13 | 2.399 e-8 | 0 | 28712年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2290010 | 2 | 170402752 | FASTKD1 | ENSG00000138399.13 | 3.265 e-8 | 0 | 27633年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs12620049 | 2 | 170404926 | FASTKD1 | ENSG00000138399.13 | 3.265 e-8 | 0 | 25459年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs79936507 | 2 | 170409031 | FASTKD1 | ENSG00000138399.13 | 3.265 e-8 | 0 | 21354年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs76216336 | 2 | 170409372 | FASTKD1 | ENSG00000138399.13 | 3.265 e-8 | 0 | 21013年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs12475814 | 2 | 170410165 | FASTKD1 | ENSG00000138399.13 | 3.281 e - | 0 | 20220年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs12475958 | 2 | 170410415 | FASTKD1 | ENSG00000138399.13 | 3.265 e-8 | 0 | 19970年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs12478568 | 2 | 170414166 | FASTKD1 | ENSG00000138399.13 | 3.265 e-8 | 0 | 16219年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs12052238 | 2 | 170415441 | FASTKD1 | ENSG00000138399.13 | 3.265 e-8 | 0 | 14944年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs16857042 | 2 | 170419108 | FASTKD1 | ENSG00000138399.13 | 3.265 e-8 | 0 | 11277年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs12467047 | 2 | 170427222 | FASTKD1 | ENSG00000138399.13 | 7.802 e - | 0 | 3163年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs746271 | 2 | 170429975 | FASTKD1 | ENSG00000138399.13 | 7.904 e - | 0 | 410年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2353192 | 2 | 170430388 | FASTKD1 | ENSG00000138399.13 | 7.904 e - | 0 | 3 | gtex_brain_putamen_basal |
rs79330162 | 2 | 170432599 | FASTKD1 | ENSG00000138399.13 | 4.303 e - | 0 | -2214年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs77692577 | 2 | 170433867 | FASTKD1 | ENSG00000138399.13 | 4.4 e - | 0 | -3482年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2353193 | 2 | 170434063 | FASTKD1 | ENSG00000138399.13 | 4.4 e - | 0 | -3678年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FASTKD1_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
ONKEN葡萄膜黑色素瘤了 | 783年 | 507年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
森古普塔鼻咽癌起来 | 294年 | 178年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
FULCHER凝集素与炎症反应有限合伙人 | 579年 | 346年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
唐克斯的目标RUNX1 RUNX1T1单核细胞融合 | 204年 | 140年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
TIEN肠道益生菌24小时 | 557年 | 331年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
周炎症反应费马DN | 284年 | 156年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金正日WT1 DN的目标 | 459年 | 276年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
多德鼻咽癌DN | 1375年 | 806年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金正日MYC放大目标 | 201年 | 127年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
伊万诺娃早期造血祖 | 532年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
瑞士POSTRADIATION肿瘤逃逸 | 393年 | 244年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
斯坦ESRRA目标了 | 388年 | 234年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RUTELLA CSF2RB和IL4 | 338年 | 225年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RUTELLA应对HGF | 418年 | 282年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RUTELLA HGF VS CSF2RB和IL4 | 408年 | 276年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
斯坦ESRRA目标 | 535年 | 325年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
弗尔涅腺泡的发育晚2 | 277年 | 172年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
开罗肝母细胞癌类了 | 605年 | 377年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森ES与H3K4ME3 ICP | 718年 | 401年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森人大与H3K4ME3 ICP | 445年 | 257年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李BMP2 DN的目标 | 882年 | 538年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |