基因页：ZDHHC14
概括？
| 基因 | 79683 |
| 象征 | ZDHHC14 |
| 同义词 | new1cp |
| 描述 | 锌指DHHC型包含14个 |
| 参考 | HGNC：HGNC：20341|Ensembl：ENSG00000175048|HPRD：15711|Vega：Otthumg0000000015896 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6Q25.3 |
| Pascal P值 | 0.001 |
| Sherlock P值 | 0.056 |
| 胎儿β | -1.861 |
| DMG | 2（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 2 |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG23389785 | 6 | 157892722 | ZDHHC14 | 2.132E-4 | 0.372 | 0.036 | DMG：Wockner_2014 |
| CG00502442 | 6 | 157801893 | ZDHHC14 | -0.019 | 0.89 | DMG：Nishioka_2013 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS1578978 | CHR8 | 118196802 | ZDHHC14 | 79683 | 0.2 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SLC39A3 | 0.78 | 0.76 |
| ydjc | 0.75 | 0.74 |
| commd5 | 0.73 | 0.70 |
| GPAA1 | 0.72 | 0.71 |
| NUDT16L1 | 0.72 | 0.71 |
| FBXW5 | 0.72 | 0.70 |
| PRR7 | 0.71 | 0.71 |
| WDR13 | 0.71 | 0.72 |
| yif1b | 0.70 | 0.66 |
| PRAF2 | 0.70 | 0.72 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.18 | -0.43 | -0.40 |
| AL139819.3 | -0.42 | -0.41 |
| AF347015.26 | -0.42 | -0.35 |
| NSBP1 | -0.40 | -0.46 |
| EIF5B | -0.40 | -0.47 |
| AF347015.8 | -0.40 | -0.32 |
| AF347015.33 | -0.40 | -0.32 |
| AF347015.21 | -0.39 | -0.33 |
| MT-CO2 | -0.38 | -0.30 |
| SEC62 | -0.38 | -0.38 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO：0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
| 去：0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
| 去：0008415 | 酰基转移酶活性 | IEA | - | |
| GO：0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Markey RB1慢性LOF DN | 118 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rozanov MMP14靶向DN | 35 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MLL AF9融合的Kumar目标 | 405 | 264 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ramalho茎DN | 74 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 营地结肠癌拷贝编号DN | 74 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zheng胶质母细胞瘤可塑性DN | 58 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan多发性骨髓瘤MS DN | 46 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sengupta EBNA1反相关 | 173 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rao由Sall4绑定 | 227 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-377 | 767 | 773 | M8 | HSA-MIR-377 | aucacacaaaggaacuuuuugu |