基因页：GAL3ST4
概括？
| 基因 | 79690 |
| 象征 | GAL3ST4 |
| 同义词 | GAL3ST-4 |
| 描述 | 半乳糖-3-O-硫代转移酶4 |
| 参考 | MIM：608235|HGNC：HGNC：24145|ENSEMBL：ENSG00000197093|HPRD：12195|Vega：Otthumg00000154885 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 7Q22.1 |
| Pascal P值 | 0.135 |
| 胎儿β | 2.483 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| 表达 | 基因表达的荟萃分析 | p价值：1.58 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG08398147 | 7 | 99766376 | GAL3ST4 | 3.216E-4 | -0.248 | 0.04 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS12785310 | Chr11 | 122601618 | GAL3ST4 | 79690 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0001733 | 半乳糖基酰胺硫代转移酶活性 | IEA | - | |
| GO：0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
| GO：0050656 | 3'-磷酸腺苷5'-磷脂结合 | nas | 11333265 | |
| 去：0050698 | 蛋白聚糖磺基转移酶活性 | nas | 11333265 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0009100 | 糖蛋白代谢过程 | nas | 11333265 | |
| 去：0007267 | 细胞细胞信号传导 | nas | 11333265 | |
| 去：0030166 | 蛋白聚糖生物合成过程 | nas | 11333265 | |
| 去：0009311 | 寡糖代谢过程 | nas | 11333265 | |
| 去：0009058 | 生物合成过程 | IEA | - | |
| 去：0006790 | 硫代谢过程 | nas | 11333265 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005794 | 高尔基体 | IEA | - | |
| 去：0005624 | 膜分数 | 艾达 | 11333265 | |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | nas | 11333265 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Doane对雄激素的反应 | 184 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周的炎症反应fima | 544 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gaussmann MLL AF4融合靶向E | 97 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 怀特赫斯特紫杉醇敏感性 | 39 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF LCP带有H3K4ME3 | 128 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen IPS LCP带有H3K27Me3 | 10 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC LCP带有H3K4ME3 | 58 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |