基因页:galnt12
概括?
基因 | 79695 |
象征 | galnt12 |
同义词 | CRCS1 | GalNAC-T12 |
描述 | 多肽N-乙酰乳糖酰氨基转移酶12 |
参考 | MIM:610290|HGNC:HGNC:19877|Ensembl:ENSG00000119514|HPRD:13561|Vega:Otthumg00000020348 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 9Q22.33 |
Pascal P值 | 0.243 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG14216997 | 9 | 101574244 | galnt12 | 4.688E-4 | 0.387 | 0.046 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GALNT12_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg o glycan生物合成 | 30 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组o粘蛋白的糖基化 | 59 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome术后翻译蛋白修饰 | 188 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
gal白血病干细胞DN | 244 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 10D的Takeda目标 | 194 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee神经Crest干细胞DN | 118 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶标为B | 26 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mohankumar TLX1靶向DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Okumura炎症反应LPS | 183 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang Smarce1靶向 | 280 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Durchdewald皮肤致癌DN | 264 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先DN | 191 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞向上 | 260 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2 CDC25A DN的射线肿瘤发生 | 159 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wagner Apo2敏感性 | 25 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang MLL目标 | 289 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |