基因页:ZMAT4
概括?
基因 | 79698 |
象征 | ZMAT4 |
同义词 | - |
描述 | 锌指矩阵型4 |
参考 | HGNC:HGNC:25844|Ensembl:ENSG00000165061|HPRD:07837|Vega:Otthumg00000164049 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8p11.21 |
Pascal P值 | 3.749E-4 |
Sherlock P值 | 0.579 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS530723 | Chr9 | 110739835 | ZMAT4 | 79698 | 0.17 | 反式 | ||
RS6036116 | CHR20 | 22430349 | ZMAT4 | 79698 | 0.11 | 反式 | ||
RS4632416 | CHR20 | 22437090 | ZMAT4 | 79698 | 0.16 | 反式 | ||
RS6048112 | CHR20 | 22442814 | ZMAT4 | 79698 | 0.14 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZMAT4_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kim Myc放大目标DN | 97 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tong与PTTG1互动 | 57 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌8p12 P11扩增子 | 57 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Iwanaga癌变由Kras Pten DN | 353 | 226 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病持续时间corr dn | 146 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肢体芽中的schmidt por目标 | 26 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |