基因页面:GTDC1
总结吗?
| GeneID | 79712年 |
| 象征 | GTDC1 |
| 同义词 | Hmat-Xa | mat-Xa |
| 描述 | 糖基转移酶与域包含1 |
| 参考 | MIM: 610165|HGNC: HGNC: 20887|运用:ENSG00000121964|HPRD: 13615|织女:OTTHUMG00000131835 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 2 q22.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.006 |
| 夏洛克假定值 | 0.63 |
| 胎儿β | -0.013 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.023 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.02395 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| GDA | 0.73 | 0.60 |
| MYRIP | 0.71 | 0.60 |
| PTPRR | 0.70 | 0.62 |
| TRHDE | 0.70 | 0.60 |
| rp4 - 788 l13.1 | 0.70 | 0.57 |
| DLGAP2 | 0.70 | 0.60 |
| 时钟 | 0.69 | 0.56 |
| NETO1 | 0.69 | 0.65 |
| GRIN2A | 0.69 | 0.55 |
| GLRA3 | 0.68 | 0.55 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| NUDT8 | -0.36 | -0.37 |
| BCL7C | -0.33 | -0.36 |
| EMX2 | -0.32 | -0.41 |
| NT5C | -0.31 | -0.31 |
| ACP6 | -0.31 | -0.30 |
| GRTP1 | -0.31 | -0.31 |
| MUTYH | -0.30 | -0.32 |
| AC132872.1 | -0.30 | -0.33 |
| IMPA2 | -0.30 | -0.35 |
| RDH5 | -0.30 | -0.22 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0016757 | 转移酶的活动,将糖基组 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0009058 | 生物合成的过程 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 图姆收缩期心力衰竭 | 423年 | 283年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN GRABARCZYK BCL11B目标 | 57 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王LMO4目标了 | 372年 | 227年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MULLIGHAN MLL签名1 DN | 242年 | 165年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SENESE HDAC3目标了 | 501年 | 327年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 压抑的徐HGF目标AKT1 DN | 95年 | 58 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN NUYTTEN NIPP1目标 | 848年 | 527年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN NUYTTEN EZH2目标 | 1024年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MOREAUX TACI了多发性骨髓瘤 | 412年 | 249年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 郑受FOXP3 | 491年 | 310年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KYNG WERNER通气和正常老化 | 93年 | 62年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHANDRAN转移DN | 306年 | 191年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 129 - 5 - p | 274年 | 280年 | 1 | hsa - mir - 129大脑 | CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGC |
| hsa - mir - 129 - 5 - p | CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGCU | ||||
| miR-132/212 | 267年 | 273年 | m8 | hsa - mir - 212深圳 | UAACAGUCUCCAGUCACGGCC |
| hsa - mir - 132大脑 | UAACAGUCUACAGCCAUGGUCG | ||||
| mir - 186 | 390年 | 396年 | m8 | hsa - mir - 186 | CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU |
| mir - 381 | 294年 | 300年 | 1 | hsa - mir - 381 | UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU |
| mir - 383 | 75年 | 81年 | 1 | hsa - mir - 383大脑 | AGAUCAGAAGGUGAUUGUGGCU |
| mir - 490 | 470年 | 477年 | 1、m8 | hsa - mir - 490 | CAACCUGGAGGACUCCAUGCUG |