基因页:NPEPL1
概括?
基因 | 79716 |
象征 | NPEPL1 |
同义词 | BA261P9.2 |
描述 | 氨基肽酶样1 |
参考 | HGNC:HGNC:16244|ENSEMBL:ENSG00000215440|HPRD:07496|Vega:Otthumg00000033060 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 20q13.32 |
Pascal P值 | 6.072E-4 |
Sherlock P值 | 0.408 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | NPEPL1 | 79716 | 0.07 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | NPEPL1 | 79716 | 5.996E-4 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NPEPL1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
U47924.1 | 0.61 | 0.63 |
Med14 | 0.61 | 0.66 |
setd5 | 0.61 | 0.67 |
NDST2 | 0.61 | 0.65 |
UBAP2 | 0.60 | 0.63 |
HGSNAT | 0.60 | 0.64 |
TMEM131 | 0.60 | 0.64 |
GBF1 | 0.59 | 0.64 |
ints3 | 0.59 | 0.66 |
mogs | 0.59 | 0.62 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.49 | -0.54 |
AF347015.27 | -0.48 | -0.53 |
MT-CO2 | -0.47 | -0.54 |
FXYD1 | -0.47 | -0.54 |
AF347015.33 | -0.47 | -0.52 |
AF347015.21 | -0.47 | -0.59 |
S100B | -0.46 | -0.52 |
AC021016.1 | -0.45 | -0.52 |
TSC22D4 | -0.45 | -0.47 |
mt-cyb | -0.44 | -0.50 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌20q12 Q13 Amplicon | 149 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TACI UP淋巴细胞的淋巴细胞成熟 | 92 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MLL AF9融合的Kumar目标 | 405 | 264 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verhaak胶质母细胞瘤经典 | 162 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ceribelli基因不活跃,受NFY的约束 | 45 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
寄养KDM1A靶向DN | 211 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |