基因页:WDR59
概括?
基因 | 79726 |
象征 | WDR59 |
同义词 | FP977 |
描述 | WD重复域59 |
参考 | HGNC:HGNC:25706|HPRD:13351| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16Q23.1 |
Pascal P值 | 0.154 |
Sherlock P值 | 0.295 |
胎儿β | 0.285 |
主持人 | 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS163352 | CHR3 | 3098040 | WDR59 | 79726 | 0.13 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/WDR59_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KIAA0317 | 0.92 | 0.93 |
ULK2 | 0.92 | 0.94 |
gnptab | 0.91 | 0.93 |
NOLC1 | 0.90 | 0.92 |
FBXW2 | 0.90 | 0.92 |
TACC2 | 0.90 | 0.93 |
FHOD3 | 0.90 | 0.92 |
RNF145 | 0.90 | 0.92 |
ALS2 | 0.89 | 0.93 |
阿卡卡 | 0.89 | 0.93 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.79 | -0.83 |
MT-CO2 | -0.78 | -0.84 |
AF347015.27 | -0.77 | -0.81 |
FXYD1 | -0.76 | -0.79 |
AF347015.33 | -0.76 | -0.78 |
mt-cyb | -0.75 | -0.79 |
AF347015.8 | -0.74 | -0.81 |
S100B | -0.74 | -0.77 |
AF347015.21 | -0.74 | -0.85 |
AC021016.1 | -0.73 | -0.79 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Mullighan MLL签名1 DN | 242 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 DN | 281 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Odonnell TFRC靶向 | 456 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Provenzani转移 | 194 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
OUILLETTE CLL 13Q14删除 | 74 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoelzel NF1靶向DN | 115 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1和SATB1的Purbey目标 | 87 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |