基因页面:NARS2
总结吗?
| GeneID | 79731年 |
| 象征 | NARS2 |
| 同义词 | DFNB94 | SLM5 | asnRS |
| 描述 | asparaginyl-tRNA合成酶2,线粒体(假定的) |
| 参考 | MIM: 612803|HGNC: HGNC: 26274|运用:ENSG00000137513|HPRD: 08026|织女:OTTHUMG00000166702 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 11 q14.1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.216 |
| 夏洛克假定值 | 0.46 |
| 胎儿β | 0.857 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 前扣带皮层BA24 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 下丘脑 硬膜基底神经节 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg15143698 | 11 | 78286037 | NARS2 | 2.02 e-8 | -0.015 | 6.99 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs9548306 | chr13 | 38876011 | NARS2 | 79731年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs7130503 | 11 | 78272226 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 1.221 e - | 0 | 13693年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7101478 | 11 | 78272517 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 2.058 e-9 | 0 | 13402年 | gtex_brain_ba24 |
| rs9666103 | 11 | 78273948 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 4.645 e-9 | 0 | 11971年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10899555 | 11 | 78274414 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 9.624 e - | 0 | 11505年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10793333 | 11 | 78274652 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 2.048 e-8 | 0 | 11267年 | gtex_brain_ba24 |
| rs67659196 | 11 | 78274854 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 2.44 e-9 | 0 | 11065年 | gtex_brain_ba24 |
| rs12808344 | 11 | 78274964 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 5.464 e - | 0 | 10955年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7129552 | 11 | 78275206 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 5.416 e-9 | 0 | 10713年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6592794 | 11 | 78275743 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 5.491 e-8 | 0 | 10176年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7936011 | 11 | 78275931 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 2.015 e - | 0 | 9988年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7929656 | 11 | 78276416 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 2.18 e - | 0 | 9503年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7940720 | 11 | 78276674 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 1.885 e-8 | 0 | 9245年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10751296 | 11 | 78277277 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 2.497 e - | 0 | 8642年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7108439 | 11 | 78277708 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 4.723 e - | 0 | 8211年 | gtex_brain_ba24 |
| rs201089218 | 11 | 78278013 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 3.721 e - | 0 | 7906年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7937225 | 11 | 78278126 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 1.012 e-8 | 0 | 7793年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10751297 | 11 | 78278567 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 4.215 e - | 0 | 7352年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10793334 | 11 | 78278792 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 1.46 e-8 | 0 | 7127年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10899556 | 11 | 78278986 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 5.168 e - | 0 | 6933年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10793335 | 11 | 78279005 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 5.198 e - | 0 | 6914年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10501429 | 11 | 78279790 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 1.884 e - | 0 | 6129年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7942527 | 11 | 78280322 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 2.557 e-8 | 0 | 5597年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7945812 | 11 | 78280509 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 2.42 e-8 | 0 | 5410年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7927494 | 11 | 78280578 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 7.089 e - | 0 | 5341年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7927503 | 11 | 78280606 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 2.018 e - | 0 | 5313年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7124803 | 11 | 78280822 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 2.47 e-8 | 0 | 5097年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10793336 | 11 | 78281867 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 6.652 e - | 0 | 4052年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4945300 | 11 | 78282632 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 1.027 e - | 0 | 3287年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4944210 | 11 | 78282878 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 6.2 e - | 0 | 3041年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4945301 | 11 | 78283362 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 6.079 e - | 0 | 2557年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4945302 | 11 | 78283454 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 7.079 e - | 0 | 2465年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4945303 | 11 | 78283803 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 9.792 e-8 | 0 | 2116年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7940507 | 11 | 78284453 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 2.266 e-8 | 0 | 1466年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7937417 | 11 | 78284470 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 1.945 e-8 | 0 | 1449年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4367973 | 11 | 78284545 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 9.603 e - | 0 | 1374年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4457782 | 11 | 78284733 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 5.838 e - | 0 | 1186年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4275650 | 11 | 78284822 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 5.819 e - | 0 | 1097年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4277140 | 11 | 78285096 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 2.497 e - | 0 | 823年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10793337 | 11 | 78285875 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 1.806 e-9 | 0 | 44 | gtex_brain_ba24 |
| rs10736814 | 11 | 78286462 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 2.361 e - | 0 | -543年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7952030 | 11 | 78270304 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 1.677 e-6 | 0.01 | 15615年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7101478 | 11 | 78272517 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 9.601 e-8 | 0.01 | 13402年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9666103 | 11 | 78273948 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 1.111 e-6 | 0.01 | 11971年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10899555 | 11 | 78274414 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 8.26 e-8 | 0.01 | 11505年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs67659196 | 11 | 78274854 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 5.028 e - | 0.01 | 11065年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7129552 | 11 | 78275206 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 7.302 e - | 0.01 | 10713年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7936011 | 11 | 78275931 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 5.511 e - | 0.01 | 9988年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7929656 | 11 | 78276416 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 3.988 e - | 0.01 | 9503年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10751296 | 11 | 78277277 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 2.486 e - | 0.01 | 8642年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7108439 | 11 | 78277708 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 1.669 e - | 0.01 | 8211年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs201089218 | 11 | 78278013 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 3.699 e - | 0.01 | 7906年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7937225 | 11 | 78278126 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 1.262 e - | 0.01 | 7793年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10751297 | 11 | 78278567 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 5.052 e - | 0.01 | 7352年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10793334 | 11 | 78278792 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 1.869 e - | 0.01 | 7127年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10899556 | 11 | 78278986 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 6.194 e - | 0.01 | 6933年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10793335 | 11 | 78279005 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 6.237 e - | 0.01 | 6914年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7942527 | 11 | 78280322 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 3.201 e - | 0.01 | 5597年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7945812 | 11 | 78280509 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 3.039 e - | 0.01 | 5410年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7927494 | 11 | 78280578 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 1.029 e-6 | 0.01 | 5341年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7927503 | 11 | 78280606 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 3.69 e - | 0.01 | 5313年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7124803 | 11 | 78280822 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 2.99 e - | 0.01 | 5097年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10793336 | 11 | 78281867 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 8.424 e - | 0.01 | 4052年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4945300 | 11 | 78282632 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 1.381 e-6 | 0.01 | 3287年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4944210 | 11 | 78282878 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 7.778 e - | 0.01 | 3041年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4945301 | 11 | 78283362 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 7.606 e - | 0.01 | 2557年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4945302 | 11 | 78283454 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 1.172 e-6 | 0.01 | 2465年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4945303 | 11 | 78283803 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 2.453 e - | 0.01 | 2116年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7940507 | 11 | 78284453 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 2.492 e - | 0.01 | 1466年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7937417 | 11 | 78284470 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 2.468 e - | 0.01 | 1449年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4367973 | 11 | 78284545 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 7.834 e - | 0.01 | 1374年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4457782 | 11 | 78284733 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 7.263 e - | 0.01 | 1186年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4275650 | 11 | 78284822 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 7.236 e - | 0.01 | 1097年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4277140 | 11 | 78285096 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 2.486 e - | 0.01 | 823年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10793337 | 11 | 78285875 | NARS2 | ENSG00000137513.5 | 1.868 e - | 0.01 | 44 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG氨酰生物合成 | 41 | 33 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME线粒体TRNA氨酰化 | 21 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME TRNA氨酰化 | 42 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ONKEN葡萄膜黑色素瘤DN | 526年 | 357年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金赛的目标EWSR1 FLII融合起来 | 1278年 | 748年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LASTOWSKA神经母细胞瘤拷贝数DN | 800年 | 473年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 总值ELK3目标了 | 27 | 16 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN NUYTTEN EZH2目标 | 1024年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NIKOLSKY乳腺癌11 q12 Q14扩增子 | 158年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MANALO缺氧DN | 289年 | 166年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马森受FOXP3刺激 | 1022年 | 619年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 华莱士前列腺癌种族DN | 88年 | 42 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| POOLA浸润性乳腺癌 | 288年 | 168年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HOSHIDA肝癌生存DN | 113年 | 76年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李BMP2 DN的目标 | 882年 | 538年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |