基因页:TTLL7
概括?
基因 | 79739 |
象征 | TTLL7 |
同义词 | - |
描述 | 微管蛋白酪氨酸连接酶像7 |
参考 | HGNC:HGNC:26242|ENSEMBL:ENSG00000137941|HPRD:08013| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p31.1 |
Pascal P值 | 0.013 |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.02692 | |
表达 | 基因表达的荟萃分析 | p价值:1.656 | |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TTLL7_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
GPS1 | 0.92 | 0.92 |
MRPS2 | 0.90 | 0.92 |
MAP2K2 | 0.89 | 0.90 |
lypla2 | 0.88 | 0.88 |
TBRG4 | 0.88 | 0.85 |
PPP2R1A | 0.88 | 0.88 |
GNB1L | 0.88 | 0.86 |
thap8 | 0.87 | 0.87 |
NOC4L | 0.87 | 0.88 |
ruvbl2 | 0.87 | 0.87 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.8 | -0.67 | -0.73 |
AF347015.33 | -0.66 | -0.72 |
AF347015.27 | -0.66 | -0.72 |
MT-CO2 | -0.65 | -0.69 |
AF347015.31 | -0.65 | -0.69 |
mt-cyb | -0.65 | -0.71 |
AF347015.15 | -0.63 | -0.69 |
AF347015.2 | -0.62 | -0.69 |
AF347015.21 | -0.62 | -0.71 |
AF347015.26 | -0.61 | -0.69 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004835 | 微管蛋白 - 酪氨酸连接酶活性 | IEA | - | |
GO:0016874 | 连接酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007399 | 神经系统的发展 | IEA | 神经突(GO期限:5) | - |
去:0006464 | 蛋白质修饰过程 | IEA | - | |
去:0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
去:0030154 | 细胞分化 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005929 | 纤毛 | IEA | - | |
去:0043204 | 植物 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
钟对偶氮替丁的反应和tsa | 183 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期DN | 367 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
chebotaev gr目标 | 77 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向F | 185 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血干细胞长期 | 302 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期S | 162 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wierenga Stat5A靶向 | 217 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-103/107 | 328 | 334 | 1a | HSA-MIR-103脑 | agcagcauuguacggcuauga |
HSA-MIR-107脑 | agcagcauuguacgggcuauca | ||||
mir-299-5p | 237 | 243 | 1a | HSA-MIR-299-5P | ugguuuaccgucccacauacau |
mir-30-5p | 253 | 260 | 1A,M8 | HSA-MIR-30A-5P | uguaaaacauccuccugagaag |
HSA-MIR-30C脑 | uguaaacauccuacucucucucucagc | ||||
HSA-MIR-30DSZ | uguaaacauccccgacuggaag | ||||
HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
HSA-MIR-30E-5P | uguaaacauccuugacugga | ||||
mir-325 | 309 | 316 | 1A,M8 | HSA-MIR-325 | ccuaguaguguccaguaagugu |
mir-369-3p | 162 | 168 | 1a | HSA-MIR-369-3P | aauauacaugguugaucuuu |
mir-374 | 162 | 168 | M8 | HSA-MIR-374 | uuauaauacaAccugauaagug |
mir-543 | 317 | 323 | 1a | HSA-MIR-543 | aaacauucgcggugcacuucu |