概括
基因 79739
象征 TTLL7
同义词 -
描述 微管蛋白酪氨酸连接酶像7
参考 HGNC:HGNC:26242|ENSEMBL:ENSG00000137941|HPRD:08013|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p31.1
Pascal P值 0.013
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.02692
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:1.656
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
GPS1 0.92 0.92
MRPS2 0.90 0.92
MAP2K2 0.89 0.90
lypla2 0.88 0.88
TBRG4 0.88 0.85
PPP2R1A 0.88 0.88
GNB1L 0.88 0.86
thap8 0.87 0.87
NOC4L 0.87 0.88
ruvbl2 0.87 0.87
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.8 -0.67 -0.73
AF347015.33 -0.66 -0.72
AF347015.27 -0.66 -0.72
MT-CO2 -0.65 -0.69
AF347015.31 -0.65 -0.69
mt-cyb -0.65 -0.71
AF347015.15 -0.63 -0.69
AF347015.2 -0.62 -0.69
AF347015.21 -0.62 -0.71
AF347015.26 -0.61 -0.69

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004835 微管蛋白 - 酪氨酸连接酶活性 IEA -
GO:0016874 连接酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007399 神经系统的发展 IEA 神经突(GO期限:5) -
去:0006464 蛋白质修饰过程 IEA -
去:0007275 多细胞生物发育 IEA -
去:0030154 细胞分化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005929 纤毛 IEA -
去:0043204 植物 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
钟对偶氮替丁的反应和tsa 183 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期DN 367 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chebotaev gr目标 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向F 185 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞长期 302 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期S 162 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wierenga Stat5A靶向 217 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-103/107 328 334 1a HSA-MIR-103 agcagcauuguacggcuauga
HSA-MIR-107 agcagcauuguacgggcuauca
mir-299-5p 237 243 1a HSA-MIR-299-5P ugguuuaccgucccacauacau
mir-30-5p 253 260 1A,M8 HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-325 309 316 1A,M8 HSA-MIR-325 ccuaguaguguccaguaagugu
mir-369-3p 162 168 1a HSA-MIR-369-3P aauauacaugguugaucuuu
mir-374 162 168 M8 HSA-MIR-374 uuauaauacaAccugauaagug
mir-543 317 323 1a HSA-MIR-543 aaacauucgcggugcacuucu