基因页面:SNIP1
总结吗?
| GeneID | 79753年 |
| 象征 | SNIP1 |
| 同义词 | pmr |
| 描述 | 1 Smad核相互作用的蛋白质 |
| 参考 | MIM: 608241|HGNC: HGNC: 30587|运用:ENSG00000163877|HPRD: 06999|织女:OTTHUMG00000004225 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 1 p34.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.316 |
| 夏洛克假定值 | 0.563 |
| 胎儿β | 0.978 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs16959318 | chr16 | 12457250 | SNIP1 | 79753年 | 0.11 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MARCH2 | 0.85 | 0.76 |
| ISOC2 | 0.85 | 0.81 |
| ASPDH | 0.85 | 0.75 |
| C2orf7 | 0.85 | 0.77 |
| C11orf59 | 0.84 | 0.75 |
| APOA1BP | 0.84 | 0.74 |
| TMEM219 | 0.84 | 0.77 |
| CISD3 | 0.83 | 0.73 |
| COX5B | 0.82 | 0.76 |
| COX4I1 | 0.82 | 0.72 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RBM25 | -0.51 | -0.57 |
| ZNF326 | -0.51 | -0.55 |
| THOC2 | -0.48 | -0.55 |
| ANKRD12 | -0.47 | -0.50 |
| RTF1 | -0.46 | -0.48 |
| C5orf42 | -0.46 | -0.45 |
| ARID4A | -0.46 | -0.45 |
| AGTPBP1 | -0.46 | -0.47 |
| SFRS12 | -0.46 | -0.49 |
| EIF5B | -0.46 | -0.55 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID SMAD2 3核通路 | 82年 | 63年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LASTOWSKA神经母细胞瘤拷贝数DN | 800年 | 473年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布伊泰尔特说光动力治疗压力 | 811年 | 508年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯应对TRABECTEDIN DN | 271年 | 175年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 结肠癌年级了 | 871年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZWANG仅由二EGF脉冲瞬变 | 1725年 | 838年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |