概括
基因 79754
象征 ASB13
同义词 -
描述 Ankyrin重复和包含13的SOCS盒子
参考 MIM:615055|HGNC:HGNC:19765|ENSEMBL:ENSG00000196372|HPRD:10667|Vega:Otthumg0000000017603
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10p15.1
Pascal P值 0.313
Sherlock P值 0.469
DMG 1(#研究)
主持人 小脑半球
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG07052796 10 5708731 ASB13 6.05e-8 -0.009 1.52E-5 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Malat1 0.68 0.74
AC137055.2 0.66 0.55
AC018638.5 0.63 0.62
ZBTB32 0.63 0.54
GP1BA 0.62 0.65
SLC34A3 0.62 0.59
DNHD1 0.61 0.66
AC087749.2 0.61 0.64
AP000769.2 0.61 0.70
AC103810.3 0.61 0.57
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CHMP5 -0.47 -0.57
CAPZA2 -0.47 -0.54
BRP44 -0.46 -0.55
MRPL13 -0.45 -0.54
C1QBP -0.45 -0.54
PSMA6 -0.45 -0.56
MRPL47 -0.45 -0.51
C18orf32 -0.45 -0.61
ATP5F1 -0.44 -0.53
NFU1 -0.44 -0.53

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome适应性免疫系统 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome I类MHC介导的抗原加工表现 251 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 212 129 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
障碍结肠癌复发DN 20 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与腔内 326 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggins他莫昔芬抗性 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伽玛辐射8G后的生存率不佳 95 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向DN 414 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时 229 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 211 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Alfano MYC目标 239 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因