基因页:ASB13
概括?
基因 | 79754 |
象征 | ASB13 |
同义词 | - |
描述 | Ankyrin重复和包含13的SOCS盒子 |
参考 | MIM:615055|HGNC:HGNC:19765|ENSEMBL:ENSG00000196372|HPRD:10667|Vega:Otthumg0000000017603 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 10p15.1 |
Pascal P值 | 0.313 |
Sherlock P值 | 0.469 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑半球 元 |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG07052796 | 10 | 5708731 | ASB13 | 6.05e-8 | -0.009 | 1.52E-5 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ASB13_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Malat1 | 0.68 | 0.74 |
AC137055.2 | 0.66 | 0.55 |
AC018638.5 | 0.63 | 0.62 |
ZBTB32 | 0.63 | 0.54 |
GP1BA | 0.62 | 0.65 |
SLC34A3 | 0.62 | 0.59 |
DNHD1 | 0.61 | 0.66 |
AC087749.2 | 0.61 | 0.64 |
AP000769.2 | 0.61 | 0.70 |
AC103810.3 | 0.61 | 0.57 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CHMP5 | -0.47 | -0.57 |
CAPZA2 | -0.47 | -0.54 |
BRP44 | -0.46 | -0.55 |
MRPL13 | -0.45 | -0.54 |
C1QBP | -0.45 | -0.54 |
PSMA6 | -0.45 | -0.56 |
MRPL47 | -0.45 | -0.51 |
C18orf32 | -0.45 | -0.61 |
ATP5F1 | -0.44 | -0.53 |
NFU1 | -0.44 | -0.53 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome I类MHC介导的抗原加工表现 | 251 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 | 212 | 129 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
障碍结肠癌复发DN | 20 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌根源与腔内 | 326 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggins他莫昔芬抗性 | 66 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伽玛辐射8G后的生存率不佳 | 95 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu eszh2靶向DN | 414 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应6小时 | 229 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 | 211 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 | 281 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Alfano MYC目标 | 239 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |