概括
基因 79770
象征 TXNDC15
同义词 C5orf14 | UNQ335
描述 硫氧还蛋白结构域含有15个
参考 HGNC:HGNC:20652|ENSEMBL:ENSG00000113621|HPRD:08658|Vega:Otthumg00000129115
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q31.1
Pascal P值 0.357
Sherlock P值 0.805
胎儿β 0.01
DMG 2(#研究)
主持人 小脑半球
小脑
皮质

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 3
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 3
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0032

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG18444519 5 134210458 TXNDC15 1.08E-4 -0.232 0.028 DMG:Wockner_2014
CG22968028 5 134209898 TXNDC15 2.08e-9 -0.009 1.66E-6 DMG:JAFFE_2016
CG24577766 5 134210730 TXNDC15 6.27E-8 -0.01 1.56E-5 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0045454 细胞氧化还原稳态 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PAX FOXO1融合的Davicioni目标 255 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼转移 344 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血中间祖先 149 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 281 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bredemeyer抹布发信号不是通过ATM提高 62 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A12 317 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因