基因页:KLHL36
概括?
基因 | 79786 |
象征 | KLHL36 |
同义词 | C16orf44 |
描述 | 像家人一样的凯尔奇36 |
参考 | HGNC:HGNC:17844|HPRD:12675| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16q24.1 |
Pascal P值 | 0.04 |
Sherlock P值 | 0.892 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 海马 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG06945845 | 16 | 84681510 | KLHL36 | 4.637E-4 | 0.321 | 0.046 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS11865946 | CHR16 | 83689142 | KLHL36 | 79786 | 0.15 | 顺式 | ||
RS443832 | CHR16 | 83779643 | KLHL36 | 79786 | 0.05 | 顺式 | ||
RS72797510 | 16 | 84690467 | KLHL36 | ENSG00000135686.8 | 1.056E-6 | 0.01 | 8336 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3751762 | 16 | 84691044 | KLHL36 | ENSG00000135686.8 | 2.259E-7 | 0.01 | 8913 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12444911 | 16 | 84691823 | KLHL36 | ENSG00000135686.8 | 1.044e-6 | 0.01 | 9692 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11149671 | 16 | 84693084 | KLHL36 | ENSG00000135686.8 | 3.406E-7 | 0.01 | 10953 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11149672 | 16 | 84693099 | KLHL36 | ENSG00000135686.8 | 3.382e-7 | 0.01 | 10968 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9319452 | 16 | 84693879 | KLHL36 | ENSG00000135686.8 | 2.602E-7 | 0.01 | 11748 | gtex_brain_putamen_basal |
RS8053324 | 16 | 84694180 | KLHL36 | ENSG00000135686.8 | 1.126E-6 | 0.01 | 12049 | gtex_brain_putamen_basal |
RS8053334 | 16 | 84694198 | KLHL36 | ENSG00000135686.8 | 3.713E-7 | 0.01 | 12067 | gtex_brain_putamen_basal |
RS62048800 | 16 | 84700219 | KLHL36 | ENSG00000135686.8 | 2.316E-7 | 0.01 | 18088 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/KLHL36_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
WDR40C | 0.71 | 0.76 |
LRRN3 | 0.66 | 0.66 |
PCDHGC4 | 0.65 | 0.70 |
LTB4R2 | 0.65 | 0.62 |
EFNB3 | 0.64 | 0.73 |
Gprin1 | 0.64 | 0.72 |
PIK3R2 | 0.64 | 0.73 |
C12orf68 | 0.64 | 0.71 |
Ankrd57 | 0.63 | 0.72 |
PCDHAC1 | 0.63 | 0.69 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
S100B | -0.47 | -0.60 |
HLA-F | -0.46 | -0.57 |
FXYD1 | -0.46 | -0.60 |
MT-CO2 | -0.46 | -0.61 |
9月4日 | -0.45 | -0.56 |
PAQR6 | -0.45 | -0.58 |
S100A1 | -0.45 | -0.61 |
AF347015.33 | -0.44 | -0.60 |
CYP2J2 | -0.44 | -0.58 |
皮尔 | -0.44 | -0.58 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江缺氧正常 | 311 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein Medulla标记 | 81 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌肉DN中的罗马胰岛素靶标 | 204 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |