概括
基因 79786
象征 KLHL36
同义词 C16orf44
描述 像家人一样的凯尔奇36
参考 HGNC:HGNC:17844|HPRD:12675|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16q24.1
Pascal P值 0.04
Sherlock P值 0.892
DMG 1(#研究)
主持人 海马
梭子基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG06945845 16 84681510 KLHL36 4.637E-4 0.321 0.046 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS11865946 CHR16 83689142 KLHL36 79786 0.15 顺式
RS443832 CHR16 83779643 KLHL36 79786 0.05 顺式
RS72797510 16 84690467 KLHL36 ENSG00000135686.8 1.056E-6 0.01 8336 gtex_brain_putamen_basal
RS3751762 16 84691044 KLHL36 ENSG00000135686.8 2.259E-7 0.01 8913 gtex_brain_putamen_basal
RS12444911 16 84691823 KLHL36 ENSG00000135686.8 1.044e-6 0.01 9692 gtex_brain_putamen_basal
RS11149671 16 84693084 KLHL36 ENSG00000135686.8 3.406E-7 0.01 10953 gtex_brain_putamen_basal
RS11149672 16 84693099 KLHL36 ENSG00000135686.8 3.382e-7 0.01 10968 gtex_brain_putamen_basal
RS9319452 16 84693879 KLHL36 ENSG00000135686.8 2.602E-7 0.01 11748 gtex_brain_putamen_basal
RS8053324 16 84694180 KLHL36 ENSG00000135686.8 1.126E-6 0.01 12049 gtex_brain_putamen_basal
RS8053334 16 84694198 KLHL36 ENSG00000135686.8 3.713E-7 0.01 12067 gtex_brain_putamen_basal
RS62048800 16 84700219 KLHL36 ENSG00000135686.8 2.316E-7 0.01 18088 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
WDR40C 0.71 0.76
LRRN3 0.66 0.66
PCDHGC4 0.65 0.70
LTB4R2 0.65 0.62
EFNB3 0.64 0.73
Gprin1 0.64 0.72
PIK3R2 0.64 0.73
C12orf68 0.64 0.71
Ankrd57 0.63 0.72
PCDHAC1 0.63 0.69
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
S100B -0.47 -0.60
HLA-F -0.46 -0.57
FXYD1 -0.46 -0.60
MT-CO2 -0.46 -0.61
9月4日 -0.45 -0.56
PAQR6 -0.45 -0.58
S100A1 -0.45 -0.61
AF347015.33 -0.44 -0.60
CYP2J2 -0.44 -0.58
皮尔 -0.44 -0.58

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江缺氧正常 311 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein Medulla标记 81 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉DN中的罗马胰岛素靶标 204 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因