概括
基因 79801
象征 SHCBP1
同义词 朋友
描述 SHC SH2结合蛋白1
参考 MIM:611027|HGNC:HGNC:29547|ENSEMBL:ENSG00000171241|HPRD:11557|Vega:Otthumg00000132540
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16Q11.2
Pascal P值 0.03
主持人 额叶皮质BA9

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.01775

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
DPP8 0.87 0.82
CHM 0.87 0.82
NCOA7 0.86 0.83
arfgef2 0.86 0.83
SENP2 0.86 0.84
FAM179B 0.86 0.80
FAM73A 0.85 0.83
SYT11 0.85 0.83
Col4a3bp 0.85 0.81
EEA1 0.85 0.81
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.42 -0.33
CLEC3B -0.39 -0.47
IL32 -0.38 -0.35
EFEMP2 -0.38 -0.38
C1orf61 -0.38 -0.44
AP003068.3 -0.37 -0.34
C16orf74 -0.36 -0.37
Rab34 -0.36 -0.36
AL022328.1 -0.36 -0.34
AF347015.18 -0.36 -0.24

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IPI 17353931
GO:0042169 SH2域结合 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
中村肿瘤区周围与中央 285 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
威尔科克斯对孕酮的反应 152 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gal白血病干细胞DN 244 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basaki YBX1靶向 290 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莱茵所有糖皮质激素治疗DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Odonnell TFRC靶向DN 139 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向DN 459 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Roylance乳腺癌16Q复制号码 63 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Roylance乳腺癌16Q副本编号DN 26 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kong E2F3目标 97 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗斯蒂宫颈癌增殖簇 140 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Furukawa Dusp6靶向PCI35 DN 74 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard粉碎和燃烧突变体DN 185 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MANALO缺氧DN 289 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer E2F1 UP 62 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Affar YY1靶向DN 234 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1定位DN的Alcalay AML 184 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nouzova维甲酸和H4乙酰化 143 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由HPV31 UP永生 84 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fujii YBX1靶向DN 202 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦凯布(McCabe)由HOXC6绑定 469 239 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先DN 191 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin DN的反应 249 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 250 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe Wnt3a靶向 112 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2 CDC25A的射线肿瘤发生 104 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ruiz TNC靶向DN 142 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标36小时DN 185 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时DN 277 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标DN 89 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类增殖 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kobayashi EGFR信令24小时DN 251 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
winnepenninckx黑色素瘤转移 162 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期g2 m 216 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 374 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时 324 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-208 455 461 1a HSA-MIR-208 auaagacgaaaaaagcuugu
mir-499 455 461 1a HSA-MIR-499 uuaagacuugcagugauguuaa