概括
基因 7982
象征 ST7
同义词 ETS7Q | FAM4A | FAM4A1 | HELG | RAY1 | SEN4 | TSG7
描述 抑制肿瘤性7
参考 MIM:600833|HGNC:HGNC:11351|Ensembl:ENSG00000004866|HPRD:09015|Vega:Otthumg0000000023888
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7q31.2
Pascal P值 0.053
Sherlock P值 0.916
胎儿β 1.051
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG00963942 7 116638247 ST7 2.38e-5 0.252 0.017 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16829545 CHR2 151977407 ST7 7982 0.02 反式
RS7787830 CHR7 98797019 ST7 7982 0.06 反式
RS16955618 CHR15 29937543 ST7 7982 0.01 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
DMXL2 0.93 0.94
Btrc 0.93 0.94
Appl1 0.92 0.93
WDR7 0.91 0.91
OPA1 0.91 0.90
Ate1 0.91 0.92
KIAA1128 0.91 0.92
Garnl1 0.90 0.91
hipk3 0.90 0.91
NF1 0.90 0.93
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
higd1b -0.63 -0.68
FXYD1 -0.61 -0.65
MT-CO2 -0.60 -0.65
PLA2G5 -0.59 -0.64
CST3 -0.59 -0.63
AF347015.21 -0.59 -0.63
AF347015.31 -0.58 -0.63
C1orf54 -0.58 -0.68
TLCD1 -0.58 -0.62
GSDMD -0.58 -0.60

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Liu Sox4靶向DN 309 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UDayakumar Med1靶向DN 240 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee神经Crest干细胞向上 146 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Midorikawa在肝癌中扩增 55 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼尔森对雄激素DN的反应 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕色髓样细胞发育DN 129 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染16小时 225 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAL PRMT5靶向 203 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染18小时 178 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染24小时 148 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性2 473 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yegnasubramanian前列腺癌 128 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向DN 292 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 281 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D 210 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌克拉斯 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Asgharzadeh神经母细胞瘤生存率差DN 46 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zembutsu对甲氨蝶呤的敏感性 18 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因