基因页:ST7
概括?
基因 | 7982 |
象征 | ST7 |
同义词 | ETS7Q | FAM4A | FAM4A1 | HELG | RAY1 | SEN4 | TSG7 |
描述 | 抑制肿瘤性7 |
参考 | MIM:600833|HGNC:HGNC:11351|Ensembl:ENSG00000004866|HPRD:09015|Vega:Otthumg0000000023888 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7q31.2 |
Pascal P值 | 0.053 |
Sherlock P值 | 0.916 |
胎儿β | 1.051 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG00963942 | 7 | 116638247 | ST7 | 2.38e-5 | 0.252 | 0.017 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | ST7 | 7982 | 0.02 | 反式 | ||
RS7787830 | CHR7 | 98797019 | ST7 | 7982 | 0.06 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | ST7 | 7982 | 0.01 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ST7_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
DMXL2 | 0.93 | 0.94 |
Btrc | 0.93 | 0.94 |
Appl1 | 0.92 | 0.93 |
WDR7 | 0.91 | 0.91 |
OPA1 | 0.91 | 0.90 |
Ate1 | 0.91 | 0.92 |
KIAA1128 | 0.91 | 0.92 |
Garnl1 | 0.90 | 0.91 |
hipk3 | 0.90 | 0.91 |
NF1 | 0.90 | 0.93 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
higd1b | -0.63 | -0.68 |
FXYD1 | -0.61 | -0.65 |
MT-CO2 | -0.60 | -0.65 |
PLA2G5 | -0.59 | -0.64 |
CST3 | -0.59 | -0.63 |
AF347015.21 | -0.59 | -0.63 |
AF347015.31 | -0.58 | -0.63 |
C1orf54 | -0.58 | -0.68 |
TLCD1 | -0.58 | -0.62 |
GSDMD | -0.58 | -0.60 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Liu Sox4靶向DN | 309 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
UDayakumar Med1靶向DN | 240 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee神经Crest干细胞向上 | 146 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Midorikawa在肝癌中扩增 | 55 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
尼尔森对雄激素DN的反应 | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕色髓样细胞发育DN | 129 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染16小时 | 225 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAL PRMT5靶向 | 203 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染18小时 | 178 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染24小时 | 148 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性2 | 473 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yegnasubramanian前列腺癌 | 128 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向DN | 292 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 | 281 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rizki肿瘤侵入性3D | 210 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌克拉斯 | 491 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Asgharzadeh神经母细胞瘤生存率差DN | 46 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zembutsu对甲氨蝶呤的敏感性 | 18 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |