基因页面:SNX22
总结吗?
| GeneID | 79856年 |
| 象征 | SNX22 |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | 排序nexin 22 |
| 参考 | HGNC: HGNC: 16315|运用:ENSG00000157734|HPRD: 15412|织女:OTTHUMG00000132965 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 15 q22.31 |
| 帕斯卡假定值 | 0.002 |
| 胎儿β | -1.348 |
| DMG | 1(#研究) |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
| 表达式 | 荟萃分析的基因表达 | P值:1.804 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg01556457 | 15 | 64443744 | SNX22 | 3.345的军医 | -0.421 | 0.041 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| DYNC2LI1 | 0.61 | 0.62 |
| MED10 | 0.60 | 0.61 |
| ACTR10 | 0.59 | 0.63 |
| EBNA1BP2 | 0.59 | 0.61 |
| ARPC3 | 0.59 | 0.62 |
| UBE2B | 0.58 | 0.62 |
| ARPC4 | 0.58 | 0.59 |
| SPATA7 | 0.58 | 0.62 |
| GGPS1 | 0.58 | 0.61 |
| FARSB | 0.57 | 0.59 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.8 | -0.53 | -0.47 |
| AF347015.2 | -0.52 | -0.47 |
| AF347015.26 | -0.51 | -0.46 |
| AF347015.15 | -0.51 | -0.47 |
| MT-CO2 | -0.50 | -0.45 |
| MT-CYB | -0.50 | -0.47 |
| AF347015.27 | -0.49 | -0.46 |
| AF347015.18 | -0.49 | -0.45 |
| MT-ATP8 | -0.48 | -0.44 |
| AF347015.33 | -0.48 | -0.45 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0035091 | 磷酸肌醇绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007154 | 细胞通讯 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0015031 | 蛋白质的运输 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 王LMO4 DN的目标 | 352年 | 225年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗德里格斯甲状腺未分化癌DN | 537年 | 339年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069年 | 729年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳人大HCP H3K4ME2 | 491年 | 319年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马顿斯维甲酸反应DN | 841年 | 431年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| STAMBOLSKY TP53突变的目标 | 49 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GOBERT少突细胞分化了 | 570年 | 339年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 146 | 2363年 | 2370年 | 1、m8 | hsa - mir - 146 a | UGAGAACUGAAUUCCAUGGGUU |
| hsa - mir - 146 b大脑 | UGAGAACUGAAUUCCAUAGGCU | ||||
| miR-23 | 1394年 | 1400年 | m8 | hsa-miR-23a大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC |
| hsa-miR-23b大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUACC | ||||
| miR-31 | 1553年 | 1559年 | m8 | hsa-miR-31 | AGGCAAGAUGCUGGCAUAGCUG |
| mir - 323 | 1394年 | 1400年 | 1 | hsa - mir - 323大脑 | GCACAUUACACGGUCGACCUCU |