基因页：Rabep2
概括？
| 基因 | 79874 |
| 象征 | Rabep2 |
| 同义词 | fra |
| 描述 | Rabaptin，Rab GTPase结合效应蛋白2 |
| 参考 | MIM：611869|HGNC：HGNC：24817|ENSEMBL：ENSG00000177548|HPRD：17948|Vega：Otthumg00000176593 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 16p11.2 |
| Pascal P值 | 0.141 |
| Sherlock P值 | 0.389 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 尾状基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | 细胞内贩运 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.01775 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG05029638 | 16 | 28936777 | Rabep2 | 5.254e-4 | -0.244 | 0.048 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS6973230 | CHR7 | 146072498 | Rabep2 | 79874 | 0.1 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| LRRC14 | 0.92 | 0.92 |
| b4galnt1 | 0.92 | 0.91 |
| WDTC1 | 0.91 | 0.89 |
| ZFYVE27 | 0.91 | 0.90 |
| VAC14 | 0.90 | 0.90 |
| RNF123 | 0.90 | 0.89 |
| GGA3 | 0.90 | 0.90 |
| Nisch | 0.90 | 0.90 |
| MBD1 | 0.90 | 0.90 |
| TBC1D25 | 0.90 | 0.89 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.75 | -0.74 |
| MT-CO2 | -0.71 | -0.65 |
| AF347015.31 | -0.70 | -0.64 |
| AF347015.8 | -0.70 | -0.65 |
| mt-cyb | -0.68 | -0.62 |
| AL139819.3 | -0.68 | -0.70 |
| AF347015.27 | -0.68 | -0.64 |
| AF347015.33 | -0.66 | -0.59 |
| AF347015.2 | -0.66 | -0.57 |
| AF347015.15 | -0.65 | -0.59 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005096 | GTPase激活剂活性 | IEA | - | |
| 去：0008083 | 生长因子活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006897 | 内吞作用 | IEA | - | |
| 去：0015031 | 蛋白质运输 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
| 去：0005769 | 早期内体 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| turashvili乳房小叶癌与小叶正常DN | 74 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌腔与基础 | 380 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌腔与间充质 | 450 | 256 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Tien肠益生菌6小时DN | 167 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wamunyokoli卵巢癌LMP | 265 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 农民乳腺癌根源与基础 | 330 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 | 165 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC目标需要MYC | 210 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom Wnt途径需要MYC | 58 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Qi Plasmacytoma Up | 259 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bohn原发性免疫缺陷综合症DN | 40 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |