基因页：NUP85
Summary？
| GeneID | 79902 |
| 象征 | NUP85 |
| 同义词 | frount | nup75 |
| 描述 | 核孔蛋白85KDA |
| 参考 | MIM：170285|HGNC：HGNC：8734|Ensembl:ENSG00000125450|HPRD：01363|Vega：Otthumg00000179482 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 17q25.1 |
| Pascal P值 | 0.06 |
| 胎儿β | 0.962 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 Frontal Cortex BA9 海马 下丘脑 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
Gene in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG15165864 | 17 | 73201778 | NUP85 | 5.09E-8 | -0.023 | 1.35E-5 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS16829545 | CHR2 | 151977407 | NUP85 | 79902 | 0 | 反式 | ||
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | NUP85 | 79902 | 0 | 反式 | ||
| rs61113346 | 17 | 73198827 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 1.515E-6 | 0.03 | -2927 | gtex_brain_ba24 |
| RS73995800 | 17 | 73191266 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 1.474E-7 | 0 | -10488 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS73995801 | 17 | 73191268 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 1.474E-7 | 0 | -10486 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10852759 | 17 | 73192415 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 1.355E-8 | 0 | -9339 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7218718 | 17 | 73192778 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 1.47E-7 | 0 | -8976 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS8065996 | 17 | 73194987 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 7.424e-8 | 0 | -6767 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11077779 | 17 | 73196329 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 1.178E-6 | 0 | -5425 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4238979 | 17 | 73197687 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 7.808e-8 | 0 | -4067 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11869880 | 17 | 73198131 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 1.298E-7 | 0 | -3623 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs61113346 | 17 | 73198827 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 1.058E-9 | 0 | -2927 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12938575 | 17 | 73203788 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 4.826E-9 | 0 | 2034 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11657106 | 17 | 73204137 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 3.793E-9 | 0 | 2383 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS899326 | 17 | 73204530 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 3.793E-9 | 0 | 2776 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12946479 | 17 | 73208182 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 2.751E-7 | 0 | 6428 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12150616 | 17 | 73208501 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 7.808e-8 | 0 | 6747 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7222849 | 17 | 73212449 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 1.716E-8 | 0 | 10695 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS545644858 | 17 | 73218136 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 1.894E-7 | 0 | 16382 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4789151 | 17 | 73219644 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 6.766E-9 | 0 | 17890 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1871269 | 17 | 73220999 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 3.793E-9 | 0 | 19245 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1478785 | 17 | 73222865 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 1.195E-7 | 0 | 21111 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS202128511 | 17 | 73226458 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 2.044e-6 | 0 | 24704 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS9988 | 17 | 73230856 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 1.863E-6 | 0 | 29102 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11077781 | 17 | 73236605 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 1.863E-6 | 0 | 34851 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2306216 | 17 | 73240559 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 1.854E-6 | 0 | 38805 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2242229 | 17 | 73242501 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 1.863E-6 | 0 | 40747 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4789157 | 17 | 73243307 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 5.76E-7 | 0 | 41553 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4789158 | 17 | 73243334 | NUP85 | ENSG00000125450.6 | 2.345e-6 | 0 | 41580 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。