基因页面:SETD6
总结吗?
GeneID | 79918年 |
象征 | SETD6 |
同义词 | - - - - - - |
描述 | 设置域包含6 |
参考 | MIM: 616424|HGNC: HGNC: 26116|运用:ENSG00000103037|HPRD: 07956|织女:OTTHUMG00000150276 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 16个温度系数 |
帕斯卡假定值 | 5.426 e-6 |
夏洛克假定值 | 0.006 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg19824325 | 16 | 58548873 | SETD6 | 3.4平台以及 | -0.015 | 7.22 e - | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs16829545 | chr2 | 151977407 | SETD6 | 79918年 | 0.05 | 反式 | ||
rs6741060 | chr2 | 217169088 | SETD6 | 79918年 | 0.13 | 反式 | ||
rs16958205 | chr13 | 101713538 | SETD6 | 79918年 | 0.14 | 反式 | ||
rs16955618 | chr15 | 29937543 | SETD6 | 79918年 | 8.068的军医 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SETD6_DE_GTEx.png)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
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CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS间充质 | 450年 | 256年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CHARAFE乳腺癌基底与间充质 | 121年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RASHI对电离辐射3的反应 | 48 | 31日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳人大HCP H3K4ME2 | 491年 | 319年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马顿斯维甲酸反应DN | 841年 | 431年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
棕熊短波紫外线反应迟 | 1137年 | 655年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |