基因页面:MAP6D1
总结吗?
| GeneID | 79929年 |
| 象征 | MAP6D1 |
| 同义词 | MAPO6D1 | SL21 |
| 描述 | MAP6域包含1 |
| 参考 | MIM: 610593|HGNC: HGNC: 25753|运用:ENSG00000180834|HPRD: 07793|织女:OTTHUMG00000156900 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 3 q27.1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.045 |
| 夏洛克假定值 | 0.14 |
| 胎儿β | -1.619 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 硬膜基底神经节 迈尔斯的顺式和反式 |
| 支持 | CompositeSet |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg18489755 | 3 | 183533873 | MAP6D1 | 4.865的军医 | 0.384 | 0.047 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs6128541 | chr20 | 57917688 | MAP6D1 | 79929年 | 0.05 | 反式 | ||
| rs35388926 | 3 | 183611051 | MAP6D1 | ENSG00000180834.3 | 2.17991 e-6 | 0.04 | -67669年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| MULLIGHAN NPM1突变特征2 | 139年 | 83年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 佩雷斯TP53的目标 | 1174年 | 695年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 乔治MIR192和MIR215的目标 | 893年 | 528年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SHEDDEN肺癌生存A6差 | 456年 | 285年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DUTERTRE雌二醇反应24小时 | 324年 | 193年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GOBERT少突细胞分化DN | 1080年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |