基因页：Syndig1
概括？
| 基因 | 79953 |
| 象征 | Syndig1 |
| 同义词 | c20orf39 | dspc2 | ifitmd5 | tmem90b |
| 描述 | 突触分化诱导1 |
| 参考 | MIM：614311|HGNC：HGNC：15885|ENSEMBL：ENSG00000101463|HPRD：12766|Vega：Otthumg0000000032104 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 20P11.21 |
| Pascal P值 | 0.489 |
| Sherlock P值 | 0.378 |
| 胎儿β | -1.035 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS16827037 | CHR3 | 117203284 | TMEM90B | 79953 | 0.01 | 反式 | ||
| RS1020772 | Chr9 | 76532511 | TMEM90B | 79953 | 0.1 | 反式 | ||
| RS12276 | CHR19 | 58154091 | TMEM90B | 79953 | 0.05 | 反式 | ||
| RS10409262 | CHR19 | 58154954 | TMEM90B | 79953 | 0.08 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 甲状腺癌DN | 232 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mohankumar TLX1靶向DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan多发性骨髓瘤MF | 47 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 华莱士前列腺癌竞赛 | 299 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 | 211 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 | 281 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |