基因页面:OBFC1
总结吗?
GeneID | 79991年 |
象征 | OBFC1 |
同义词 | AAF-44 | AAF44 | RPA-32 | STN1 | bA541N10.2 |
描述 | 寡核苷酸/ oligosaccharide-binding包含1折 |
参考 | MIM: 613128|HGNC: HGNC: 26200|HPRD: 14872| |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 10 q24.33 |
帕斯卡假定值 | 0.019 |
夏洛克假定值 | 0.006 |
胎儿β | -1.21 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg24587175 | 10 | 105670608 | OBFC1 | 1.268的军医 | -0.502 | 0.03 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs4592237 | chr1 | 4280629 | OBFC1 | 79991年 | 0.16 | 反式 | ||
rs2304127 | chr19 | 56896573 | OBFC1 | 79991年 | 5.186 e-5 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/OBFC1_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
刘SOX4目标了 | 137年 | 94年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
加里CD5目标了 | 473年 | 314年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
周炎症反应生活的DN | 384年 | 220年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
周炎症反应费马DN | 284年 | 156年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
杨乳腺癌ESR1激光 | 34 | 25 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
斯坦ESRRA目标了 | 388年 | 234年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
斯坦ESRRA目标 | 535年 | 325年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
棕熊短波紫外线反应迟 | 1137年 | 655年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |