基因页：GLRA3
概括？
| 基因 | 8001 |
| 象征 | GLRA3 |
| 同义词 | - |
| 描述 | 甘氨酸受体α3 |
| 参考 | MIM：600421|HGNC：HGNC：4328|ENSEMBL：ENSG00000145451|HPRD：02688|Vega：Otthumg00000149816 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 4Q34.1 |
| Pascal P值 | 0.732 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：4 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG09841488 | 4 | 175750527 | GLRA3 | 2.667E-4 | -0.236 | 0.038 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS695809 | CHR22 | 26278127 | GLRA3 | 8001 | 0.05 | 反式 | ||
| RS330478 | 4 | 176050287 | GLRA3 | ENSG00000145451.8 | 2.10962E-6 | 0.02 | -299822 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS5864311 | 4 | 176108113 | GLRA3 | ENSG00000145451.8 | 2.54893E-6 | 0.02 | -357648 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1491416 | 4 | 176109168 | GLRA3 | ENSG00000145451.8 | 8.63185E-7 | 0.02 | -358703 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1121867 | 4 | 176111188 | GLRA3 | ENSG00000145451.8 | 2.89645E-6 | 0.02 | -360723 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12641212 | 4 | 176114955 | GLRA3 | ENSG00000145451.8 | 8.8121E-7 | 0.02 | -364490 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| 战争 | 0.91 | 0.91 |
| ITFG1 | 0.90 | 0.88 |
| sucla2 | 0.90 | 0.88 |
| prkar1a | 0.90 | 0.91 |
| ATP2A2 | 0.89 | 0.90 |
| AP3M2 | 0.89 | 0.89 |
| plekhb2 | 0.89 | 0.92 |
| ywhab | 0.89 | 0.87 |
| arl8b | 0.89 | 0.91 |
| NDUFS1 | 0.89 | 0.87 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.59 | -0.37 |
| AF347015.18 | -0.56 | -0.40 |
| AP002478.3 | -0.54 | -0.46 |
| AF347015.2 | -0.53 | -0.34 |
| MT-CO2 | -0.53 | -0.38 |
| higd1b | -0.52 | -0.38 |
| AC098691.2 | -0.52 | -0.41 |
| AF347015.8 | -0.52 | -0.37 |
| CSAG1 | -0.51 | -0.39 |
| AL139819.3 | -0.51 | -0.43 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0030594 | 神经递质受体活性 | IEA | 神经递质（GO期限：5） | - |
| 去：0004890 | GABA-A受体活性 | IEA | GABA（GO期限：7） | - |
| 去：0005216 | 离子通道活动 | IEA | - | |
| 去：0005230 | 细胞外配体门控离子通道活性 | IEA | - | |
| 去：0005230 | 细胞外配体门控离子通道活性 | nas | - | |
| GO：0016934 | 细胞外基因门控氯化物通道活性 | IEA | - | |
| GO：0031404 | 氯离子结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007268 | 突触传输 | nas | 神经元，突触，神经递质（GO期限：6） | - |
| 去：0006821 | 氯化物运输 | IEA | - | |
| 去：0006811 | 离子运输 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0045211 | 突触后膜 | IEA | 突触，神经递质（GO期限：5） | - |
| GO：0045202 | 突触 | IEA | 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：2） | - |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | nas | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| GO：0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG神经活性配体受体相互作用 | 272 | 195 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome离子通道传输 | 55 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome配体门控离子通道传输 | 21 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lein Midbrain标记 | 82 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 麦凯布（McCabe）由HOXC6绑定 | 469 | 239 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McCabe Hoxc6靶向癌症 | 31 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由SALL4同工型绑定的RAO A | 182 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |