基因页面:LRRTM4
总结吗?
| GeneID | 80059年 |
| 象征 | LRRTM4 |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | 富亮氨酸重复跨膜神经4 |
| 参考 | MIM: 610870|HGNC: HGNC: 19411|运用:ENSG00000176204|HPRD: 11288|织女:OTTHUMG00000152842 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 2 p12 |
| 帕斯卡假定值 | 0.036 |
| 胎儿β | -0.403 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
| 支持 | G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS G2Cdb.humanPSD G2Cdb.humanPSP |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs843350 | chr3 | 183946273 | LRRTM4 | 80059年 | 0.12 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| LMTK2 | 0.88 | 0.88 |
| FBXL18 | 0.87 | 0.89 |
| PIP5K1C | 0.86 | 0.88 |
| PHLPP2 | 0.86 | 0.87 |
| SH2B3 | 0.85 | 0.86 |
| SIK2 | 0.85 | 0.85 |
| TGOLN2 | 0.85 | 0.87 |
| C17orf51 | 0.85 | 0.86 |
| 上 | 0.85 | 0.88 |
| FBXO41 | 0.84 | 0.82 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| DBI | -0.49 | -0.57 |
| AL139819.3 | -0.45 | -0.53 |
| AF347015.21 | -0.45 | -0.46 |
| GNG11 | -0.43 | -0.49 |
| RAB13 | -0.42 | -0.49 |
| C1orf54 | -0.42 | -0.52 |
| NSBP1 | -0.41 | -0.46 |
| AP002478.3 | -0.41 | -0.46 |
| RHOC | -0.41 | -0.47 |
| AF347015.18 | -0.40 | -0.39 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| MOHANKUMAR TLX1目标了 | 414年 | 287年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃造血干细胞 | 254年 | 164年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马顿斯维甲酸反应了 | 857年 | 456年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VERHAAK胶质母细胞瘤颈板 | 177年 | 132年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |