基因页面:CENPT
总结吗?
GeneID | 80152年 |
象征 | CENPT |
同义词 | C16orf56 | CENP-T |
描述 | 着丝粒蛋白T |
参考 | MIM: 611510|HGNC: HGNC: 25787|运用:ENSG00000102901|织女:OTTHUMG00000173071 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 16 q22.1 |
帕斯卡假定值 | 0.001 |
夏洛克假定值 | 0.065 |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs16829545 | chr2 | 151977407 | CENPT | 80152年 | 0.07 | 反式 | ||
rs3845734 | chr2 | 171125572 | CENPT | 80152年 | 0.19 | 反式 | ||
rs17104720 | chr14 | 77127308 | CENPT | 80152年 | 0.18 | 反式 | ||
rs16955618 | chr15 | 29937543 | CENPT | 80152年 | 7.495 e-5 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CENPT_DE_GTEx.png)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MRPL52 | 0.92 | 0.84 |
TCEB2 | 0.90 | 0.83 |
BLOC1S1 | 0.90 | 0.73 |
AP000350.6 | 0.89 | 0.79 |
AC009171.1 | 0.88 | 0.83 |
POLR2I | 0.88 | 0.76 |
TIMM8B | 0.87 | 0.81 |
CHCHD5 | 0.86 | 0.78 |
NDUFA11 | 0.86 | 0.78 |
NDUFB7 | 0.85 | 0.77 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MYH9 | -0.48 | -0.46 |
COBLL1 | -0.47 | -0.56 |
WNK1 | -0.46 | -0.55 |
SYNM | -0.46 | -0.60 |
FLT1 | -0.46 | -0.62 |
GPR116 | -0.45 | -0.54 |
DST | -0.45 | -0.52 |
UTRN | -0.45 | -0.54 |
PTPN11 | -0.45 | -0.43 |
PK4P | -0.45 | -0.54 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
REACTOME细胞周期 | 421年 | 253年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME细胞周期有丝分裂 | 325年 | 185年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME有丝分裂M M G1阶段 | 172年 | 98年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME DNA复制 | 192年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME有丝分裂前中期 | 87年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由阿霉素GRAESSMANN细胞凋亡 | 1142年 | 669年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GRAESSMANN MC和阿霉素 | 612年 | 367年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MOHANKUMAR TLX1目标了 | 414年 | 287年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
里克曼转移DN | 261年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
徐gh外源目标 | 85年 | 50 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SHEDDEN肺癌生存A12好 | 317年 | 177年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GOBERT少突细胞分化了 | 570年 | 339年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
杨BCL3目标了 | 364年 | 236年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ZWANG仅由二EGF脉冲瞬变 | 1725年 | 838年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |